譚嗣同因病，延至9月才趕到北京，光緒帝召見了他，叫他凡認為應變的事，隨時條陳。9月5日，光緒帝特別給譚嗣同、劉光第、楊銳、林旭等四品卿銜，擔任軍機處章京，被稱作“軍機四卿”。到9月21日發生政變，新政只實行了103天，史稱“百日維新”。

在這一段時間，康有為今天一個奏章，明天一項條陳，經過光緒帝的批准，把奏章、條陳變為詔書、諭令，一共有110多起，從紫禁城裡雪片般飛出來。基本內容如下：

1�廢除八股，改革科舉制度。

２�設立學堂，學習西學。

３�派人出國遊學、遊歷。

４�獎勵新著作、新發明。

５�獎勵創辦報刊，提倡上書建議。

６�保護和獎勵農工商業。

７�修築鐵路，開採礦產。

８�廣辦郵政，裁撤驛站。

９�設計規章條例，精簡機構，裁減不必要的官員。

維新運動掌旗手：康有為（5）

10�改革財政，編制預算決算。

11�精練海軍，改用新法操練。

12�准許旗人自謀生計。

頑固後黨大反撲

推行新政，當然不能不觸犯一些人的利益。就在變法詔書下達的第四天，西太后便串同頑固大臣榮祿等，著實部署力量，準備發動政變。先是把翁同龢撤除職務，傳送江蘇原籍；隨即調王文韶回京供職；命二品以上文武大臣謁見西太后。這3道命令，替頑固派發動政變完成了準備工作。

西太后又和榮祿商定，在秋天要光緒帝陪同她去天津閱兵，到時便以兵力逼迫光緒帝退位，另立由她完全控制的新君。

9月初，後黨發動政變的跡象越來越明顯，光緒帝覺察到這種嚴重形勢，便下“密詔”，嚴令康有為迅速出走，留著性命，將來好為“皇上”出力。9月19日上午，康有為去見才到中國不久的前日本總理大臣伊藤博文，請他在西太后面前說幾句話，以緩和對光緒帝的壓力，便化裝逃離北京。

9月18日，譚嗣同訪袁世凱於法華寺，要袁世凱舉兵殺榮祿，圍頤和園，以救“皇上”，立下功勳。並告以：“如果你不欲救皇上，向頤和園告密，殺了我的頭，也可以得大官。”狡猾的袁世凱竟激昂地說：“你把我袁某看作什麼人？皇上是我們共事的聖主，救護的責任是你的，也是我要擔當的。”還說：“閱兵時，如果皇上迅速跑到我袁某的軍營裡，殺一個榮祿就像殺一條狗一樣！”

原來袁世凱做過強學會的會員，瀛臺舊照他擁有一支7000人的新練武裝駐紮在離天津70裡的小站，距北京不遠。如果他能站在維新派的一邊，則可防止政變，皇帝生命可保，因此譚嗣同才去央求他。

9月20日，光緒帝召見袁世凱，在奏答時，袁世凱故意說：“新進諸人閱歷太淺，辦事不能縝密，倘有疏誤，累及皇上關係極重，總求十分留意。”言下之意，是在推卸責任。當天晚上，即把譚嗣同的策劃向榮祿告密。榮祿得到袁世凱的密報，大驚失色，立刻掛專車到北京，飛奔頤和園，向西太后告發。

9月21日晨，西太后從頤和園急急趕回紫禁城，直入光緒帝寢室，吆喝光緒帝說：“我撫養你二十多年，竟聽小人的話，要謀害我！”光緒帝結結巴巴地說：“我沒有這個意思。”西太后恨恨地罵道：“蠢東西，今天沒有我，明天還會有你嗎？”便拿走一切檔案，囚禁光緒帝於中南海的瀛臺，接著用皇帝的名義，釋出籲請西太后訓政的詔書，西太后又一次“臨朝聽政”。

9月22日，榮祿派兵3000名，封鎖北京各城門，斷絕交通，搜捕維新人士和保皇黨人，許多人被捕下獄。9月28日，下令處死康廣仁（康有為的弟弟）、楊深秀、楊銳、林旭、譚嗣同、劉光第六人，史稱“戊戌六君子”。

康有為已事先出京，在英國人掩護下，才擺脫追捕，逃往香港。梁啟超則在日本人掩護下，化裝逃出北京，直奔日本。

後來，康有為又從香港亡命日本。當時孫中山已在日本建立革命的基地，聽到康有為危機一發，從虎口逃生，親自到他下榻地方去拜訪。康有為以“身為帝傅，不見叛賊”為由，拒絕和孫中山相見。康有為一直隱藏在神戶的須磨警察署長的家裡，又抗時代潮流，組織“保皇會”，和“同盟會”對抗。辛亥革命後，康有為又參加了“復辟運動”，變成一個典型的反動派。

1927年，康有為去世。活了六十九歲。他和日婦之間生