貢白珠五千孔,青大句珠二珠,異文雜錦二十匹”,由此可見,當時倭國還是將活人做為一種商品。後來因為神州陷入戰亂,其國和神州的交往受到阻礙,神州史書上沒有再記錄此國的情況。
神州進入魏晉南北朝的動亂時期後,受其影響,朝鮮半島也發生較大的變化。地處中國東北部的高句麗不斷向朝鮮半島北部擴張其領土,西晉末年,趁神州政權衰弱的機會吞併神州大漢政權設定的樂浪郡。此時在朝鮮半島南部,還有三個小國家的聯合體,即馬韓、辰韓、弁韓。後來馬韓、辰韓演變成百濟、新羅,弁韓仍是小國聯合,其地區被稱為伽耶。
此時倭國中的邪馬臺古國已經突然消失,因為沒有史書記載,到底此國發生了什麼事情也無人可以知道,甚至連它為何被別的政權所取代,也無人可以說清楚。等神州大陸再次和倭國有所來往之時,倭國已經有一個新興政權取代了邪馬臺國,世稱大和國,這是倭國曆史上一個非常重要的政權,但此時神州史書仍然稱其為倭國。這個時候,和倭國一海相望的朝鮮半島也爆發了戰爭,高句麗和新羅兩國都有心統一朝鮮半島,而受到高句麗新羅入侵壓力的百濟、伽耶兩國和倭國保持著密切的關係,大和國也借這個機會積極插手朝鮮半島事務,暗地裡控制了伽耶不少地區,史書記載,神州十六國時代,百濟曾與大和軍隊一道進攻過新羅。
神州東晉末期和十六國時期,大和國一方面透過插手朝鮮半島各國的戰事,獲取各種先進的技術,另外一方面還派出使臣到神州朝貢,大和國在這一時期先後13次遣使到東晉、宋、梁各朝,要求給予冊封。根據《宋書·;蠻夷傳·;倭國》的記載,