尊經書院山長之聘，留黃侃於蓉城延師授讀。因家用匱乏，黃侃奉母命寄書告父，並於書末綴一詩云：“父作鹽梅令（指其父曾任四川鹽茶道），家存淡泊風，調和天下計，杼軸任其空。”時黃雲鵠之摯友、宜昌王鼎丞自山西布政使解職後客居江寧，讀小季剛詩，詫為奇才，即以其女許之，這就是黃侃的原配王夫人。黃父見到幼兒寫的家書，既激動又慚愧，遂和詩一首：“昔曾司煮海，今歸食無鹽；慚愧七齡子，哦詩奉父廉。”

9歲的黃侃已能讀《經》，日逾千言，人呼“神童”。其父以書諭之曰：“爾負聖童之譽，須時時策勵自己，古人愛惜分陰，勿謂年少，轉瞬即壯志矣。”十歲時，黃侃已讀完四書五經。

父親黃侃對他的教育特別重視，把自己從四川帶回來的幾十箱書集中在一個屋子裡，作為他讀書的地方，上題“歸學處”三個字。黃侃正是在這間小屋裡打下了堅實的國學功底。十三歲時，父親病逝，母承父志，仍請人在“歸學處”課業，上完課時常常已是深夜，母親仍秉燭在外面等著。此時家中偏門已鎖，常常要翻山從小徑繞到大門回家，辛苦之極。母親恐他有畏難情緒，問道：“汝亦知求生之道乎？”黃侃深知母親苦心，慨然答道：“讀書而已。”

黃侃13歲喪父，因系庶（妾）出，頗受歧視。喪父之後，黃侃所受刺激甚深，立志劬學以在大家庭中立足，其銳敏勤學亦絕人。

黃侃15歲考中秀才。不久清廷廢科舉、興學堂，黃考入湖北文普通中學堂為第一期學員。同學中有宋教仁等人，稍後有查光佛、鄭江灝、歐陽瑞驊、董用武（必武）等。這些人後來都成為著名的革命黨人。

【師徒】

黃侃與章太炎相識於日本。當時黃侃住樓上，章太炎住樓下。一天夜晚，黃因內急，不及上廁所，便從樓窗中解褲洋洋直瀉。章太炎此時夜讀正酣，驀地一股腥臊尿水瀑布般往下飛濺，禁不住高聲怒罵。黃侃本系貴公子出身，且正年輕性躁，盛氣凌人，也報以回罵。不罵不相識，待雙方互通姓名後，彼此都熟知對方大名，遂將話鋒轉到學問上，兩人越談越投機。章太炎是淵博絕倫的樸學大師，黃侃便折節稱弟子。自此，黃侃師從章太炎問學經年。章太炎清高孤傲，對近世文人極少嘉許，惟獨對黃侃刮目相待。

黃侃與其師章太炎的相識還有一種版本，一次黃侃隨眾人往章太炎住所拜謁，看到章在牆上用大字寫著東漢戴良的四句話：“我若仲尼出東魯，大禹長西羌，獨步天下，誰與為偶？”黃覺得章為人太狂，恐難接近，萌生退意。後章在報上看到黃的文章，驚為奇才，投書約見，二人遂得以相識。

黃侃跟章太炎在東京住了三年多，一直埋頭苦讀，不時向章請教。可笑的是，他跟章甚久，始終沒有“拜師”的形式，章很以為奇。到黃侃決定回國，向章求臨別贈言，太炎先生說：“你要拜一個好老師常常指教你才好。”他問什麼人好，太炎說：“北京找劉申叔（劉師培）吧。”他答：“暫時不想去北京。”太炎說：“只講孫詒讓也好。”他答：“不想到浙江。”太炎說：“陳伯韜在南京，你可去找他。”答：“南京恐怕去不了。”太炎說：“那怎麼辦？萬不得已，就是我勉強點吧！”這時黃侃才認真地磕頭，算是拜了師。從此黃侃位列章太炎門牆，章太炎對黃的學識也十分激賞，曾誇道：“恆言學問進益之速，如日行千里，今汝殆一日萬里也。”

章太炎曾對幾位高足一一封號：蘄春黃侃（季剛）為天王，吳縣汪東（旭初）為東王，海鹽朱希祖（逖先）為西王，歸安錢夏（中季）（即錢玄同）為南王，歙縣吳承仕（檢齋）為北王，合稱“五大天王”。世人又稱黃侃、汪東為“章門二妙”。幾大天王中黃侃最得章氏青睞，章稱其“清通之學、安雅之詞，舉世罕與其匹……”

章太炎《新方言》出版時，不請同輩，卻請黃侃為他寫《後序》，也足見其對黃的看重。

黃侃雖自視甚高，目中無人，但對老師章太炎卻執禮甚恭。這一對師生惺惺相惜，留下許多趣聞。“前中大教授黃季剛先生，為章氏最得意弟子，季剛先生事章氏恭謹又倍於他人，黃有弟子陳君，亦能傳其衣缽，主章家為西席，章氏以西席禮待之。每逢新年，季剛先生必詣章宅叩賀，至必行跪拜禮，黃叩章，陳又叩黃，章又向陳行禮。坐定，陳舉茶敬黃，黃敬章，章又敬其西席，如此迴圈不絕，家人傳為笑談。”

黃侃對恩師章太炎執禮甚恭，汪闢疆說他“二十餘年間執弟子禮始終甚謹”。“‘於並世老宿多譏彈’，惟於太炎先生，則始終服膺無間。有議及章先生