對於寓言類、傳奇類科幻小說，它們的自設邏輯並非出自科學原理。作者設定此類自設邏輯，意在表達某個主題。在著名的科幻短篇《冷酷的平衡》裡，飛船的燃料和給養只能維持一個船員，多出一個都不能承受，必須有一個人被拋入太空，如果心生憐憫就得雙雙斃命。這就是這篇故事的“自設邏輯”。

讀者讀完後莫不為之扼腕。紛紛試圖修改這個“只限一人”的殘酷條件：那麼大的飛船，怎麼就裝不下兩個人的給養！飛船檢查嚴密，那個少女根本不可能登上來！他們可以遇到另一條船提供補給！更有的讀者指出，這個前提離科學很遠，作者本來想怎麼設定就可以怎麼設定。所以，作者是故意“殺死”那位姑娘的。確實如此，在這篇故事裡，只有這個自設邏輯最能震憾人心。任何“心軟”的假定都違背了故事的主題：宇宙規律不以人的意志為轉移的冷酷性！

在科幻小說《獻給阿杰爾農的花》中，主人公查理經過手術後，從弱智成為超人，又恢復弱智。這就是本篇的核心自設邏輯。讀者會問，他的智力提升後，不能自己研究出新的手術方法嗎？其他更高明的科學家不能挽回他的智力嗎？當然作者也可以這麼去假設。但那樣就削弱了本篇的主旨：由於智力變化而導致主人公社會地位的變化。再從這種變化裡，描寫社會的人情冷曖。

除了直接預言或宣示主題外，某些自設邏輯還負有使情節更精彩的作用。它往往給時空加上了許多限制，使角色必須在這些限制中完成任務。比如田中芳樹在《銀河英雄傳說》�