在朝廷特使近衛前久、勸修寺晴豐等人的安排下，顯如上人寫下誓書，宣佈停止對織田信長的抵抗，淨土真宗放棄根據地攝津石山，以及北陸的加賀，前往它處和平傳教。

顯如上人隨即離開本願寺，遁往紀伊的鷺森隱居，其子本願寺光壽（教如）仍然不捨這座本寺，但堅持到當年八月，終於還是被迫離開。名雖和睦，其實本願寺勢力等於徹底向織田信長繳槍，表示臣服，持續十一年的石山戰爭就此落下帷幕。

●“天下至惡”的結局

尾張的小諸侯織田信長所以能夠在戰國群雄中脫穎而出，與尾張國所處的地理位置、政治經濟狀況密不可分，同時和信長本人的性格與政策也是分不開的。織田信長最大的性格特點就是藐視權威，他敢於革新，只要有利於自己的統治，任何勢力都可以打倒，任何情感都可以拋棄。

從尾張時代起，織田信長就非常注重商業的發展。當時日本大小諸侯割據，道路殘破，關卡林立，城下町的商業也多被當地行會所壟斷，非常不利於商品經濟的發展。信長花很大精力修葺道路和橋樑，廢除領地上的關卡，同時採取“樂市樂座”制度，以打破行業壟斷。所謂“樂市樂座”，是指在城下町專闢場所，任何人都可進入經營商業，只要按時向領主繳納賦稅，就不必經過當地行業公會同意。這種領地內的自由貿易政策，信長並非始作俑者，只不過他執行得更為徹底和完善而已。此外，信長還鑄造“大判”（一種金幣），統一領內的貨幣。

在農業方面，織田信長一方面強力鎮壓一揆，一方面確定封建領主制，採取“兵農分離”、“檢地”（重新丈量土地，確定準確的年貢額）和“刀狩”等政策，力圖將農民牢牢禁錮在土地上。當時大部分封建諸侯並無常備兵，武士除還要擔任行政任務外，也可能下地種田，農民在作戰時也會被臨時徵發入伍。信長採取“兵農分離”政策，把武士常備兵化，而禁止農民脫離生產，加入到爭鬥的行列中去。這一政策，後來更發展為“刀狩”，即沒收農民所持有的武器，以防轉業和暴動。

政治方面，織田信長先是挾室町將軍以號令天下諸侯，繼而廢黜足利義昭，滅亡室町幕府。同時，他尊奉天皇朝廷，希望建立雙頭傀儡政治，對足利義昭產生一定製約，而等義昭已被放逐，他又以“征伐未盡其功”為藉口，放棄了朝廷賜予的一切官職，想把天皇朝廷也一腳踢開。為了將織田政權名正言順地納入天皇朝廷體系，天正九年（1581年），正親町天皇遣使赴信長處，希望他可以擔任左大臣一職，然而信長竟以天皇退位作為條件：“若誠仁親王得以繼位，我將擔任官職，悉心輔佐。”為了對抗朝廷，他甚至策劃扛出足利義昭之子足利義尋擔任第十六代幕府將軍，反過來分割朝廷的影響力。

這種藐視甚至完全無視權威的激進做法，無疑把織田信長推到了一個與天下各勢力為敵的危險境地中。再加上他唯力為視，對百姓則嚴刑峻法，對家臣則要求嚴苛，微過必懲，就在他達到輝煌頂峰的時候，織田政權內部各種矛盾就已經開始激化了，反叛此起彼伏。

首先是松永久秀的謀叛。似乎腦有反骨的久秀，前此已經多次向織田信長掀起過反旗了，只因畿內尚未平定，信長在快速進攻，打得久秀開城投降後，也就只給小懲大誡，依舊允其重歸家臣團。但是到了天正五年（1577年），聽聞“越後之龍”上杉謙信將要上洛的訊息後，松永久秀、久通父子突然從石山本願寺外撤兵，退守居城大和信貴山。信長立派長子織田信忠集合畿內兵馬前往討伐。十月十日，松永久秀彈盡援絕，自殺而亡，結束了他相當富有戲劇性的一生。

松永久秀這個“天下至惡”，畢生行事往往出人意表，認為是該謀叛的時候，他總是忠誠地跟隨著信長，以效犬馬之勞，而當誰都不注意他的時候，久秀卻開始蠢蠢欲動——就連最後的自殺，他也表現得與眾不同。據說信長一直垂涎久秀收藏的名茶器“平蜘蛛釜”，但軟磨硬泡，用盡種種手段，久秀卻堅持不肯獻上。此次信貴山城被圍，信長傳話說：“交出平蜘蛛釜，我就饒你一命。”久秀聞言冷笑：“我已經快七十歲了，去日無多，何必要你饒恕？不過，你也休想得到我心頭至愛。”於是把平蜘蛛釜內塞滿火藥頂在頭上，引燃火繩，“轟”的一聲，“天下至惡”與“天下至寶”一起化為飛灰。

爆炸所引起的大火，燒盡了信貴山城本丸，松永一族男女老幼全都葬身火海。恰好就在十年前的同月同日，松永久秀與“三好三人眾”相爭，為了避免奈良東大寺的大佛殿被敵人佔領作為據點，乾脆放一把火，將這