也就是說，皇帝總領九大機構，行使國家最高決策權力。在這九大機構中，主要的輔助決策機構是郎中令、尚書丞、奉常、宗正、太子太傅五大機構，其餘四大機構為皇室事務機構。

其二，中央政務系統：以丞相為軸心的三公九卿系統。

三公是：丞相、太尉、御史大夫。三公稱謂，來自周室官制，為太師、太傅、太保，為遠古官制中地位最為尊崇的三人。春秋戰國之世，三公之實不在，三公之說猶存，多為對地位尊崇的權臣的一種敬意說法。帝國官制明確以丞相、太尉、御史大夫為三公，便是確立了這三個機構的政務軸心地位，與周代三公的“協理陰陽”之類的虛事有本質的不同。帝國三公，各為一個系統——

丞相綜合系統：開府總領國政，設左右丞相，亦稱相國，多有下屬事務官署。

太尉兵政系統：開府總領涉軍政務，以老秦國尉府擴大而設。

御史大夫監察系統：開府，監察百官並天下郡縣，以原御史署及原國正監擴大而設。

三公之下為九卿。九卿者，分別執掌九大領域之施政系統也。之所以將九卿置於三公之下，其實際作用在於明確層級權力：九卿在三公（主要在丞相）領導之下施政，以保不政出多門。九卿之中，五卿隸屬皇帝系統，四卿隸屬三公系統。三公之四卿為：廷尉（執法機構，設左監、右監、獄正三署，側重受命於御史大夫府），治粟內史（以原大田令府擴大而設，掌經濟民生諸事，隸屬丞相系統），典客（以原行人署、屬邦署合併擴大，掌邦交併邊陲部族事務，隸屬丞相府），少府（以原關市、邦司空等署合併擴大而設，掌國家賦稅，設六丞，隸屬丞相府）。

九卿之外，帝國尚有若干散官機構，或歸皇帝系統，或歸三公系統。中央主要散官機構是：客卿（才士之虛職，可與聞國事，多為試用，皇帝系統任命，任事歸丞相系統），博士學宮（以博士僕射為主官，設博士七十餘人，掌典教禮儀博通古今，備諮詢國政，皇帝系統任命，任事亦主要隸屬皇帝系統），中尉（掌京師治安，設兩丞，轄斥候、司馬、千人三署，隸屬太尉系統），內史（掌京師政務，列中央官吏，隸屬丞相系統）。

其三，郡縣施政系統：郡守縣令為軸心的地方系統。

郡官主要是：郡守（一郡主官，總掌政事，後世稱太守），郡丞（輔助郡守掌事，郡守之副），郡尉（一郡武官，掌守軍並治安事），監御史（中央之御史大夫派進各郡的監察郡政之官員，後世改稱刺史），郡法官（掌律法典籍並律法答問，備官員民眾諮詢），郡卒史（掌郡文書事，轄書吏十人），主簿（掌一郡財政賦稅，或兼領文書事），斷獄都尉（掌一郡司法，受中央廷尉府與郡守雙重管轄），牧師令（邊疆郡設定，掌畜牧，屬吏六人），長史（邊疆郡設定，爵同郡丞，掌兵馬）。

縣官主要是：縣令（一縣主官，總掌政事）、縣丞、縣尉、縣法官、獄椽等，職司與郡同名官一致。除此之外，縣府有若干辦事吏：道嗇夫（掌官道修築及維護），倉嗇夫（掌禾倉，並按民戶收糧），田嗇夫（掌督導耕耘），苑嗇夫（掌監護山林水面），廄嗇夫（掌督導牛馬牲畜之繁殖養育）。

其四，鄉官系統：最基層的三級民治——鄉、亭、裡。

這個最基層的治民系統，當從最下說起。據《漢書·百官公卿表》記載，秦時一縣，土地大體在方百里上下，人口眾多的縣地面稍小，人口稀少者則地廣。但總體說來，都比後世的縣要大得多。為此，縣以下分三級治理：

最下施治單元為裡，大體相當於後世的村。裡設里正一人，統掌行法施政。里正之下，設里宰一人（掌均平分肉），裡監門一人（護衛里正），伍老（掌五家行法連坐事，多少以裡轄民戶數目而定）。

十里為一亭，設亭長一人，統管全亭施政到民；亭有吏員四人：亭父（掌亭所開閉掃除雜務，亦稱亭卒），求盜（掌亭內治安，亦為亭卒之一，若後世捕快），田典（掌督察民戶耕耘），牛長（掌每年四次督察耕牛，並賽牛賞功事）。不久之後，列位看官將遇到掀起天下大波瀾的一個著名亭長——劉邦。

十亭組成一鄉。鄉官，以三老為最尊。所謂三老，本指上壽（百二十歲）、中壽（百歲）、下壽（八十歲）三種老人。作為帝國施治的鄉三老，大體是八十歲上下的三位老人，執掌民風民俗教化，以利法令推行，是以列位鄉官之首。鄉政的真正施治官吏，是有秩（總掌鄉政）、嗇夫（掌聽訟、賦稅）、遊徼（掌捕盜）。

如上四大系統，非但在戰國