其二就是在統一全國後，協助秦始皇推行了一套新制度：即廢除分封制，實行郡縣制以及實行書同文、車同軌、統一度量衡，明法度，定律令，對外征討四夷等等。

關於廢除分封、實行郡縣制的問題，李斯說：“周武王所封子弟同姓甚眾，然後屬疏遠，相攻擊如仇讎，諸侯更相誅伐，周天子弗能禁止。今海內賴陛下神靈一統，皆為郡縣，諸子功臣以公賦稅重賞賜之，甚足易制。天下無異意，則安寧之術也。置諸侯不便。”

關於統一思想、進行焚書的問題，李斯說：“今陛下並有天下，別白黑而定一尊，而私學乃相與非法教之制，聞令下，即各以其私學議之。入則心非，出則巷議，非主以為名，異趣以為高，率群下以造謗。如此不禁，則主勢降乎上，黨與成乎下。禁之便。臣請諸有文學《詩》《書》百家語者，蠲除去之。令到滿三十日弗去，黥為城旦。若有欲學者，以吏為師。”

李斯在這些地方都表現得氣大聲宏、鋒芒畢露，其思想對於穩定秦王朝的統治起了一定作用。前者所闡發的廢除分封制、實行郡縣制的問題完全是金玉良言，一直到一千多年後柳宗元寫《封建論》，繼續批判分封制的時候，仍然在闡發李斯當年所表達過的思想。後者對焚書的說法與為統一思想而�