議，又選舉了黎元洪為副總統，孫中山向會議報告了內閣成員名單：

陸軍總長 黃　興

海軍總長 黃鐘瑛

外交總長 王寵惠

內務總長 宋教仁

財政總長 陳錦濤

司法總長 伍廷芳

教育總長 章太炎

實業總長 張　謇

交通總長 湯壽潛

但是，這個名單中的宋教仁和章太炎，沒有得到與會代表的同意，作了修改後才予以透過，最後確定的內閣成員名單如下：

陸軍總長　黃　興 次長　蔣作賓

海軍總長　黃鐘瑛 次長　湯薌銘

外交總長　王寵惠 次長　魏宸組

內務總長　程德全 次長　居　正

財政總長　陳錦濤 次長　王鴻猷

司法總長　伍廷芳 次長　呂志伊

教育總長　蔡元培 次長　景耀月

實業總長　張　謇 次長　馬君武

交通總長　湯壽潛 次長　于右任

同時，黃興兼任參謀總長，成為首席部長。南京臨時政府不設內閣總理，總統掌握大權，而各部採取了“部長取名，次長取實”，成為所謂的“次長內閣”，權力完全掌握在同盟會手裡。宋教仁沒有能夠出任部長，僅被任命為法制局長，章太炎則被聘任為總統的樞密顧問。

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