自從劉協決定離間李傕郭汜之後，他就漸漸地疏遠了吳懿。

對此，吳懿也沒有任何表示，他仍然如往常一樣，在朝堂上任職，他也懶得向劉協再進行解釋，不過有一點他其實也非常高興，對他有知遇之恩的李傕，即將覆滅。雖然這麼做有些忘恩負義，但是他知道李傕和董卓一樣都是大惡人，而他自己將要面對李郭之亂，很可能受到波及，而將來他正好有機會擺脫李傕，讓自己成為大漢天子任命的官員：只要自己協助曹操救出天子，那時候皇帝當然會原諒之前他為李傕所做的一切幫助。

而李傕在楊奉董承的安排後，看到了吞併樊稠的機會之後，他儘管也想召集吳懿商議，如果真的商議了，吳懿礙於面子也不可能不告訴他此時時機不成熟，那麼這個平行歷史就可能向另一個方向發展了。可惜由於誘惑過於巨大，時間也比較緊急，他沒有和吳懿商議，就殺了樊稠，他想著如果自己順利吞併樊稠就足以以現在的實力打敗郭汜一統西涼軍，可惜實際上樊稠的部隊和郭汜一起合力攻擊最強的李傕軍，導致雙方勢力消耗巨大之後仍然不分勝負，於是和三國演義上一樣，李傕劫持天子，郭汜劫持大臣，雙方開始對峙。

然而這個位面上解決事件的楊彪已經病故了，所以劉協面對如此變局一下慌亂了，他沒想到西涼軍內亂的後果不僅沒有解救出自己，反而導致瞭如此變故。沒辦法，他只能急召當初勸阻他離間李傕郭汜的吳懿，希望靠他來解決這次危機。

而吳懿也不負眾望，他和歷史上的楊彪一樣成功勸說了兩家釋放天子和大臣，唯一不同的是，李傕本來想要留下他，但是吳懿選擇了跟隨劉協一起行動。

“吳懿，雖然我的部隊損失慘重，但也比郭汜和樊稠舊部強大不少，如果你願意幫助我，肯定能打敗敵人，到時候不比跟著皇帝受苦強？”李傕問。

吳懿只是說：“不好意思，可是我還是更希望能在皇帝身邊，畢竟我一直都是在保護他的。”

李傕明白吳懿的意思，吳懿打算拋棄自己了，但是吳懿在長安也給他出了不少主意，他最終還是放吳懿離開了。

但是李傕郭汜忙著內戰，皇帝和逃出來的大臣都沒有糧食吃，而直到此時，吳懿才說出了之前馬忠去找曹操救援的事情，最終曹操也成功的到達並救出了皇帝一行人。

劉協對吳懿的態度立刻大為改觀，他佩服吳懿的先見之明，成功救出了他們所有人，又責罵了楊奉等人，說：“悔不該當初不聽吳懿的諫言，才遭此大禍啊！”於是，劉協立刻給吳懿加官進爵，吳懿也只是謝恩領賞，沒有表現的特別喜悅。

戲志才聽說了這件事，不顧自己的病軀，對曹操諫言：“寵辱莫驚，去留吳懿。吳懿有大才而且可以不管自己榮辱，主公可以儘快拉攏他，只要打動了吳懿，得到他的幫助，那麼曹公便可輕易地平定天下，況且現在拉攏他很容易，如果吳懿走了那就麻煩了。如果能得到吳懿，我死而無憾。”