機的攻擊又接踵而至，七分鐘後，又有兩條魚雷命中左舷，剛剛有所恢復的左傾再度加劇，而且舵機失靈，“大和”號升起了遇難旗，航速只剩下7節，甲板上到處是彈洞，被炸開的鋼板四下翻卷，由於左傾已達15度，大口徑高炮已經無法操縱，只有25毫米的機關炮還能勉強射擊。十四時零二分，一批美機俯衝而下，投下的炸彈有三枚在左舷中部爆炸，使其左傾加大到35度。十四時零七分，一條魚雷擊中右舷，此時“大和”號上層建築面目全非，全艦被濃煙烈焰所包圍，完全喪失了機動能力，防空火力微乎其微，又不能進行機動來規避，淪落到任人宰割的地步。十四時十二分，四架美軍魚雷機衝出雲層從容實施攻擊，如同是在進行魚雷攻擊表演，美機攻擊動作十分完美，投下的魚雷有兩條命中左舷中部和後部。“大和”號升起了緊急求救訊號旗，通知驅逐艦靠幫接走艦員，但驅逐艦知道“大和”號彈藥艙裡近2000發460毫米主炮炮彈只發射了3發，現在隨時都有爆炸的可能，都不敢靠近，“大和”號的左傾急劇增大，艦員已經無法站立，很多人不等艦長下達棄艦命令就自行跳海逃生，艦長有賀見此情景，也知道“大和”號已經無可挽救，只得下令棄艦。十四時十五分，又有一條魚雷擊中左舷中部，傷痕遍體的“大和”號再也經受不住，左傾達到80度，甲板幾乎與海面垂直，終於在十四時二十分傾覆沉沒，460毫米前主炮炮膛裡的炮彈滑落下來，撞穿了彈藥艙甲板，引爆了艙中的炮彈，劇烈的爆炸簡直將“大和”號艦體炸斷，烈焰沖天而起，翻*的蘑菇狀煙柱竟高達1000米，甚至連110海里外鹿兒島的居民都看到了大爆炸的火光與濃煙，海面上頓時出現一個深達50米的旋渦，不多時，後主炮炮塔裡的彈藥也在水下爆炸，鋼鐵的碎片從水下飛濺而出，爆炸的氣浪連海面上掙扎的水兵都感到一陣窒息，伊藤中將和有賀大佐以下2498名艦員隨艦葬身海底，只有269人獲救。——這些生還者於1967年組成名叫“大和會”的戰友會，並在臭名昭著的靖國神社樹立紀念碑，碑上刻有一幅“大和”號的浮雕，碑頂放有一枚“大和”號460毫米主炮的穿甲彈，經常聚會追憶往昔。作為倭國海軍聯合艦隊象徵，排水量6。8萬噸的巨型戰列艦“大和”號的沉沒，標誌著聯合艦隊的徹底覆沒，同時也宣告了鉅艦大炮主義的徹底破產。

在美軍攻擊“大和”號的同時，部分美機也對“矢矧”號巡洋艦和驅逐艦發動了攻擊，“矢矧”號已經喪失了機動能力，美軍轟炸機和魚雷機進行的攻擊動作漂亮、出色，簡直是教科書式的表演，“矢矧”號累計被擊中七條魚雷和十二枚炸彈，於十四時零五分傾覆沉沒。

“磯3”號、“朝霞”號和“霞”號驅逐艦也先後遭到重創，不得不自行鑿沉。

當“大和”號沉沒後，第四十一驅逐艦大隊大隊長吉田正義大佐接替指揮，他一面組織殘餘艦隻打撈落水人員，一面向聯合艦隊司令發電報告戰況並請示下一步行動指示。十六時三十九分，聯合艦隊司令豐田鑑於預期計劃已無法實現，決定終止海上特攻，吉田隨即率領餘下的4艘驅逐艦帶著創傷，於8日回到了佐世保基地。

美軍的戰列艦、巡洋艦編隊還未投入戰鬥，日軍的這支海上特攻艦隊就被美軍艦載機所消滅，美軍共出動艦載機386架次，其中戰鬥機180架次，轟炸機75架次，魚雷機131架次，被日艦擊落10架。

倭國海軍在沖繩海域活動的11艘潛艇，由於美軍反潛兵力雄厚，警戒嚴密，未獲任何戰果反被擊沉8艘，至此，倭國海軍對沖繩島守軍的支援均告失利，雖然其空中特攻作戰給美軍造成不小的損失，但對整個登陸戰役，起不了決定性的影響。

“大和”號的沉沒，正式宣告了戰列艦作為海戰戰場主角的時代已經徹底終結了。

與盟軍在海空作戰取得的輝煌勝利，甚至和琉球島中部和北部幾乎是一帆3順的地面戰鬥不同的是，美國陸軍第二十四軍對南部地區的進攻卻非常艱難，因為日軍在沖繩島的主力就部署在南部，而且充分利用懸崖峭壁、深溝高谷等險峻地形構築起堅固隱蔽的防禦工事，所以美軍進展極其緩慢。牛島原本在大本營的一再督促下，準備於4月8日發動對機場總反擊，但在4月7日下午，發現那霸附近海面有美軍數百艘艦船活動，牛島擔心美軍會從反擊部隊的側後實施登陸，加上他本來對這次反擊就不積極，正好以此為藉口取消了反擊，而將全部兵力用於依託工事進行堅守防禦，給二十四軍造成了很大困難。

4月9日，由於二十四軍遭到了頑強抵