衛指揮使司”和“俄力思軍民元帥府”，派駐大批官員，分別管理前後藏、昌都以及阿里等地的軍政事務。

但與西藏相比之下，滿清的駐疆大臣，權力還是大不少。乾隆在對準格爾實行了種族滅絕以後，信仰藏傳佛教的民族在新疆就不能佔據主導地位了。於是，伊斯蘭教徒的自主權力就開始大了起來，管理當地伊斯蘭教徒的頭目，滿清稱之為“回王”，意思就是回教徒的“王”。乾隆以後，滿清政府和回教徒在新疆經常發生衝突，以至於爆發大規模的戰爭。此時的滿清駐疆大臣也就會把回王抓起來殺掉或者廢掉，再換上一個新的回王，可見滿清在新疆還是應該有一些控制能力的。

但是，駐疆大臣的這種權力，和諸如我們盛唐時期的安西大都護的巨大權力，那是絕不可同日而語的。滿清在新疆的統治的穩固性比起唐朝來，更不是差的一星半點兒。

最令人可笑的是，滿清自乾隆以後一直就在向與新疆接壤的浩罕汗國繳納歲幣。不僅如此，由於新疆有不少的浩罕人在那裡做生意，滿清居然又做出了一項“偉大的發明”，那就是浩罕的商人不但可以在新疆自由地做生意，浩罕政府還可以派人在新疆對