短短兩個月的時間裡，就完成了徵兵和組建工作，以大中軍五五編制的老習慣，新編近衛第三師下轄五個滿編戰兵營（步兵營），同時按照肖天健的旨意，又為其編入了一個兩千人規模的加強騎兵營，另外加上一個師屬重炮營和一個滿編輜重營以及一個工兵營，使得新編近衛第三師的兵力達到了一萬人左右的規模。

而這些新兵兵員的來源，則以順天府以及永平府等地的當地民眾為主，卻並沒有收編多少投降的三大營的官兵，原因無他，這個時候的明軍官兵可以說已經是爛透了，雖然降兵之中也不乏一些精壯之士，但是這些人也都早已變成了老兵痞子，身上帶了太多的明軍之中的舊習，再想改變他們，就相當不容易了，一旦將這些兵痞子編入軍中之後，非但不利於提高戰鬥力，相反還會起到很大的副作用。

所以在肖天健的旨意下，這些大明降兵，多被就地遣散打亂安置，令其到各地務農為生，每個人在遣散的時候，還發給了二十兩遣散費和一定量的糧食，省的他們沒錢吃飯，遣散之後又落草為寇，為禍一方。

至於新編第三師的都統，在諸將的提議之下，肖天健將原本在劉耀本手下當副都統的李定國提拔了起來，充任了近衛第三師的都統，其餘的軍官也都是從諸軍之中拔擢起來的大中軍的老部下，其中以講武堂學員出身的軍官為主，撐起了近衛第三師的骨架。

雖然從組建開始，新編近衛第三師組建的時間很短，但是有這幫干將充作骨幹，第三師很快便投入到了緊張的操練之中，短短兩個月時間，便基本上結束了大中軍新兵訓練的科目，初步擁有了一定的戰鬥力，估計最多一年時間這支兵馬在這些軍官們的操練下，肯定也能成為一支兇悍的軍隊，戰鬥力會相當可觀的。

至於鎮守山海關的那兩萬多吳襄麾下的明軍舊部，則在肖天健的指令之下，被改編為了大中軍山海關守備師，歸到了北方戰區的序列之中，暫時繼續留鎮山海關，但是要求北方戰區對其進行一次大規模的整編和重新訓練，增強山海關守備師的戰鬥力，使之在半年之內，成為一支真正能堪大用的兵馬。

但是肖天健卻將彥書亭派至了山海關，充當了吳襄的副手，另外又從各部之中抽調了二百軍官，以及剛剛在講武堂結業的五百講武堂學員也派至了山海關，充入到了這支兵馬之中，以他們重新構成了這支守備師的基層軍官和高層軍官的骨架。

原來吳襄麾下的兩萬多官軍，也就地整編，裁撤掉了其中一批不符合大中軍要求的官兵，但是對這批官兵，畢竟他們都參與了這一次山海關大戰，所以好歹算是有功人員，所以肖天健特許沒有采取像對待一般降兵那樣的就地裁撤的辦法，而是以大中軍退役的待遇，發放給了他們一筆優厚的遣散費，並且每人補發了半年軍餉，令其返鄉。

雖然這些官兵有點不太滿意，但是也無可奈何，更何況大中朝對他們已經算是非常寬厚了，發放的安家費也相當充足，所以值得脫下了軍服，然後離開了山海關，在裁撤不合格兵將的同時，又就地在山海關內的北方難民之中，招募起了一批新兵，充實到了守備師之中，保證了守備師兩萬兵力並沒有下降。

如此一來，整個守備師便發生了翻天覆地的變化，基本上從根子上，重新將其編排了一番，也避免了這些舊官軍形成小的集團。

吳襄因為被繼續留任都統之職，而且也見識到了大中軍的厲害，所以對於這一次的整編十分配合，並且也按照大中朝的命令，解散了麾下的家丁隊，將其編入到了麾下各營之中，一部分表現不錯的直接被派往了南京講武堂進行為期一年的培訓，今後將另行安排，也算是給他的家丁們了一個相當不錯的出路，對此吳襄倒是十分感激。

並且吳襄暗中上奏肖天健，在奏疏之中提出，他以年紀大為由，表示在完成山海關守備師整編之後，他願意辭去都統之職，回到北京城中跟家人一起養老，從此不再幹軍務之事。

吳襄其實是個非常聰明之人，他透過和閻重喜、王承平、羅立、劉耀本這些人這段時間的接觸，發現了大中軍跟明軍的最大不同之處，那就是大中軍的軍制，從根本上限定了這些大中軍兵將，不可能再像明軍那樣，讓軍將擁兵自重，形成大大小小的軍閥集團。

而他也很清楚即便是他掌握著這兩萬多明軍舊部，今後肖天健也絕不容他擁兵自重，肯定會想辦法拆分掉他麾下的這些兵馬，徹底的杜絕他擁兵自重的可能性。

於是弄明白這一點之後，吳襄立即便做出了選擇，畢竟他也年紀不小了，在大中軍之中即便是再混下去，也不可