北京方面聽到宋氏被刺，也極感震動，尤以國民黨總部喪失了實際的領導人，既哀悼又激憤，紛紛去電上海詢問真相。黃興乃於22日致電北京《民主報》主持人仇蘊存，說明宋氏被刺遇難經過，請刊諸報端，宣示中外，電文如下：

“北京《民主報》仇蘊存兄：疊接都中諸友來電殷殷垂問宋鈍初先生受傷情形，刻值治喪忙迫，未及一一擬答，殊深歉仄。特詳述於下，請登諸報端，以慰哀感。鈍兄於念夜十時四十五分由滬赴京，在車站被奸人由背後施槍，彈由右脊腰上部掠腎臟穿大腸直透下腹皮停止，當即送入附近鐵道醫院醫治。此時鈍兄傷雖重而精神如常，然自知必死，即口授致大總統電文，並述對將來之政見，一一告別同志，絕不提及家事，惟雲老母年高，不可使知變狀。十二時卅分即將子彈取出，念一日午後二時，復集醫士五人剖治，又將腸傷縫補滌盡，遺出食物及汙血，仍合其口此後神人不諒，死不瞑目矣，竟爾絕命。嗚呼！當此國勢飄搖之際，而有如此奸徒，不顧大局，戕賊人道，行此暗殺手段，痛何如之，諸君當亦同聲一哭也。兇徒正在密探，尚未緝獲，謹此訃聞。”

袁世凱在北京作成毫不知情狀，他於21日得知宋被刺訊息，表示非常意外，即發一電雲：

“上海宋鈍初先生鑑：閱路透電，驚聞執事為暴徒所傷，正深駭絕。頃接哿電，方得其詳。民國建設，人才至難，執事學識冠時，為世推重，凡稍有知識者，無不加以愛護，豈意眾目昭彰之地，竟有兇人，敢行暗殺，人心險惡，法紀何存？惟祈天相吉人，調治平復，幸勿作衰敗之語，徒長悲觀。除電飭江蘇都督、民政長、上海交涉使、縣知事、滬寧鐵路總辦，重懸賞格，限期緝獲兇犯外，合先慰問。”

22日午後4時，袁方午睡初起，秘書等奔告宋去世訊息，袁還愕然說：“有這等事嗎？快拿電報來。”秘書捧了束電報來，是陳貽範一電，黃克強一電，江孔殷一電。袁做出極惋惜的樣子說：“這怎麼好呢？國民黨失去了宋純初，少了一個明白事理的首腦，以後越難講話了。”這時他還命秘書草擬電報，草擬優恤命令，處理宋身後事，他假惺惺地想借這些來沖淡宋的慘死，他的慰問電雲：

“宋君竟爾溘逝，曷勝浩嘆！目前緊要關鍵，惟有重懸賞格，迅緝真兇，徹底根究。宋君才識卓越，服務民國，功績尤多，知與不知，皆為悲痛。所有身後事宜，望即會同鍾文耀（即滬寧鐵路總辦）妥為料理。其治喪費用，應即作正當開銷，以彰崇報。”

他以為這次宋被刺事件是天衣無縫，永不會被人所知。他捻髯微笑，認為又輕輕易易地去了一個政敵，可是表面上卻裝出一個“壞我棟樑”的樣子，並且下了一道緝兇命令，有“暗殺之風，尤乖人道”云云。

宋教仁遇刺殉難，使已經是風雨欲來的時局，變成了大雷暴雨，也是剛滿15個月的中華民國一件最聳人聽聞、觸目驚心的事。

對於宋為何被刺？何人所刺？各有說法，言人人殊。於是謠言不脛出走，大多數人尤其是國民黨方面，均認為是袁世凱，可是北洋方面則散播空氣說宋被刺是國民黨內訌，自相殘殺。

宋的政見和孫中山，和黃興，和國民黨內一部分人相左是事實。如南京臨時政府時代，宋堅主責任內閣，其他人均反對，後來定都南北之爭，宋亦是主張定都北京，與孫、黃定都南京意見不同。國民黨的組成，宋的策劃和貢獻最大，因而成為實際的領導人，一部分革命黨和同盟會中人對宋也頗不滿，這些都是事實，當國民黨組成後，外間謠言甚熾，宋教仁曾於民國元年9月16日發表一封致各報的公開信：

“連日各報載國民黨事諸多失當，甚且如《民視報》等謂孫中山先生辭理事職出於鄙人之排斥，《新紀元報》等謂孫、黃有衝突，皆不勝駭異。此次國民黨之合併成立，全出於孫、黃二公之發意，鄙人等不過執行之，故黨員無論新舊，對於孫、黃二公皆非常愛戴。此次選舉理事，孫先生得票最多，惟孫先生此後欲脫離政界專從事於社會事業，故不欲任事，曾經辭職，已由鄙人與各理事再三挽留，始允不辭，現已推為理事長。鄙人與孫先生從事革命幾及十年，何至有意見之爭，且國民黨新立，正賴有功高望重如孫先生者為之主持，亦何至有內訌之原因耶？至於黃克強先生與孫中山先生同為吾黨泰斗，關係之親切，天下皆知，此次北來調和南北意見，主持大計，兩公無絲毫之歧異，更何至有衝突之事，如各報所云云乎。方今時事艱難，非有強大真正之政黨作中流之砥柱，何能挽回危局。而強大真正之政黨，尤非社會扶持，各黨互