發表通電：願意撤退上海地域內所有兩省駐軍，廢除護軍使及鎮守使名目，反對以後再設類此軍職，兵工廠亦即日擇地遷移。北京執政府亦頒佈處置浙、滬問題三令：（一）淞滬護軍使一缺著即裁撤。（二）上海兵工廠著陸軍部即日飭令停止軍用工作，以便招商承領改組商業工廠，並先委託上海總商會暫行接收，妥為保管，即由該部遴派專員會同該商會妥籌辦理。（三）上海嗣後永遠不得駐紮及設定何種軍事機關。

1月16日北京執政府令：

“此次蘇浙軍隊發生衝突，聞齊燮元有從中煽惑情事。……應另派員查辦外，嗣後各該省軍長官，務各嚴飭所部，恪守疆界，不得輕信謠諑，致啟釁端。如再有前項情事，定惟各該長官是問。”

又令：

“暫兼督辦江蘇軍務善後事宜韓國鈞，準免兼職。特任蘇皖宣撫使盧永祥兼督辦江蘇軍務善後事宜。特任方本仁督辦江西軍務善後事宜。長江上游總司令王汝勤著兼任幫辦湖北軍務善後事宜。山東、福建督理缺員著即裁撤。特任鄭士琦督辦山東軍務善後事宜。孫傳芳督辦浙江軍務善後事宜。周蔭人督辦福建軍務善後事宜。派盧金山為長江上游副司令。”

盧永祥在南京自有一套想法，其實對他來說仍是舊調重彈，他於三年前做浙江督軍時，因受第一次直奉戰爭影響，曾一度通電倡議廢督，通電中慷慨陳詞，一時極為輿論所讚美，可惜後來盧氏對於通電所提倡的事，僅能做到改“督軍”名稱為“軍務善後督辦”而止。致輿論對他頗為失望。

14年2月27日盧永祥又電段祺瑞籲請廢督。他的電文中有不少的警句：

“……廢督之議創之久矣！上既憚而莫敢為，下遂鍥而不忍舍。一日不廢，則一日不能息民。廢督以前大要者二，曰定軍制、曰劃軍區。然此非一省之事也，有一省以創之，中央鼓其激昂之氣，推之鄰省焉。推之全國焉。則事無不舉矣。�