者果有此事，亦未可知。”神宗嘆息數聲，覆命居正錄詩以進。居正道：“這乃亡國遺詩，何足寓目！請錄皇陵石碑，及高皇帝御製文集，隨時備覽，想見創業艱難，聖謨隆盛呢。”神宗稱善。至次日，居正即錄皇陵碑文呈覽。神宗覽畢，即語居正道：“朕覽碑文，讀至數過，不覺感傷欲泣了。”居正道：“祖宗當日艱難，至於如此。皇上能效法祖宗，方可長保大業哩。”乃申述太祖微時情狀，及即位後勤儉等事。神宗愴然道：“朕承祖宗大統，敢不黽勉，但也須仗先生輔導呢！”由是累有賞賜，不可勝紀。最著的是銀章一方，鐫有“帝賚忠良”四字。又有御書匾額兩方，一方是“永保天命”，一方是“弼予一人”。

居正以在閣辦事，只有呂調陽一人，不勝煩劇，復引薦禮部尚書張四維。四維嘗饋問居正，四時不絕，所以居正一力薦舉。向例入閣諸臣，嘗雲同某人等辦事，至是直稱隨元輔居正等辦事。四維格外謙恭，對著居正，不敢自稱同僚，彷彿有上司屬吏的等級，平時毫無建白，只隨著居正拜賜進宮罷了。卑屈至此，有何趣味。惟四維入閣後，禮部尚書的遺缺，就用了萬士和。士和初官庶吉士，因忤了嚴嵩，改為部曹，累任按察布政使，並著清節，及入任尚書，屢上條奏，居正頗嫉他多言。會擬越級贈朱希忠王爵，士和力持不可，給事中餘懋學，奏請政從寬大，被居正斥他諷謗，削籍為民。士和又上言懋學忠直，不應摧抑，自遏言路。種種忤居正意，遂令給事中朱南雍，奏劾士和，士和因謝病歸休。

適薊州總兵戚繼光，擊敗朵顏部長董狐狸，生擒狐狸弟長禿，狐狸情願降附，乞赦乃弟。繼光乃將長禿釋回，酌定每歲貢市，一面由巡按遼東御史劉臺，上書奏捷。居正以巡按不得報軍功，劾臺違制。臺亦抗章劾居正，說他擅作威福，如逐大學士高拱，私贈成國公朱希忠王爵，引用張四維等為爪牙，排斥萬士和、餘懋學等，統是罔上行私的舉動，應降旨議處等情。居正自入閣秉政，從未遇著這種彈章，見了此疏，勃然大怒，當即具疏乞歸。神宗急忙召問，居正跪奏道：“御史劉臺，謂臣擅威福，臣平日所為，正未免威福自擅呢。但必欲取悅下僚，臣非不能，怎奈流弊一開，必致誤國。若要竭忠事上，不能不督飭百官。百官喜寬惡嚴，自然疑臣專擅。臣勢處兩難，不如恩賜歸休，才可免患。”說至此，隨即俯伏，泣不肯起。無非要挾。神宗親降御座，用手掖居正道：“先生起來！朕當逮問劉臺，免得他人效尤。”居正方頓首起謝。當下頒詔遼東，逮臺入京，拘繫詔獄，嗣命廷杖百下，擬戍極邊。居正反上疏救解，故智復萌。乃除名為民。未幾，遼東巡撫張學顏，復誣劾臺匿贖鍰，想是居正嗾使。因復充戍潯州。臺到戍所，就戍館主人處，飲酒數杯，竟致暴斃。這暴斃的情由，議論不一，明廷並未詰究，其中弊竇，可想而知，毋庸小子贅說了。不說之說，尤勝於說。

到了萬曆五年，居正父死，訃至京師。神宗手書宣慰，又飭中使視粥止哭，絡繹道路，賻儀格外加厚，連兩宮太后，亦有特賻，惟未曾諭留視事。時李幼孜已升任戶部侍郎，欲媚居正，首倡奪情的議論。馮保與居正友善，亦願他仍然在朝，可作外助，遂代為運動，傳出中旨，令吏部尚書張瀚，往留居正。居正也恐退職以後，被人陷害，巴不得有旨慰留，但面子上似說不過去，只好疏請奔喪，暗中恰諷示張瀚，令他奏留居正。瀚佯作不知，且雲：“首相奔喪，應予殊典，應由禮部擬奏，與吏部無涉。”居正聞言，很是忿恨。又浼馮保傳旨，責瀚久不復命，失人臣禮，勒令致仕。於是一班趨炎附勢的官員，陸續上本，請留首輔，奏中大意，無非把移孝作忠的套話，敷衍滿紙。移孝作忠四字，豈是這般解法。居正再請終制，有旨不許。又請在官守制，不入朝堂，仍預機務，乃邀允准。連上朝都可免得，是居正死父，大是交運。居正得遂私情，仍然親裁政務，與沒事人一般。

會值日食告變，編修吳中行，及檢討趙用賢，刑部員外郎艾穆，主事沈思孝等，應詔陳言，均說居正忘親貪位，煬蔽聖聰，因幹天變云云。居正得了此信，憤怒的了不得，當下通知馮保，教他入訴神宗，概加廷杖。大宗伯馬自強，急至居正府第，密為營解。居正見了自強，略談數語，便撲的跪下，帶哭帶語道：“公饒我！公饒我！”自強正答禮不迭，忽聞掌院學士王錫爵到來，居正竟踉蹌起身，趨入喪次。錫爵徑至喪次中，晤見居正，談及吳、趙等上疏，致遭聖怒等事。居正淡淡的答道：“聖怒正不可測哩。”錫爵道：“聖怒亦無非為公。”語尚未訖，居正又跪倒地上，勃然道：“公來正好！快把我首級取去，免致得罪諫