久而久之，這些村子也都變成了半獨立的狀態，他們平時自給自從，戰時則會以協力的形式加入自己支援的一方諸候，與別人作戰，這就是具有東洋特色的懋村的由來。

忍者裡就是在這種懋村的基礎上出現的，當年一個名叫細川的有力大名，一度曾經控制了日本的中央將軍府，相當於日本版的曹操，志得意滿之際，想要收拾一下靠近京都一帶的大和國和紀伊國裡的這些懋村，於是帶了兩萬多大軍掃蕩這些不服王化的村落，結果這些村落裡的山民們利用地形，逃進山中，採用游擊戰術，神出鬼沒地打擊數量龐大但失之笨重的細川軍，最後居然奇蹟般地打退了細川大軍，從此聲名大噪。

這些神出鬼沒，在黑暗中行動的山民們也被稱為忍者，而其首領也就此成立了幾個忍者裡，相當於中國的武林門派，大規模地招收和訓練全國各地慕名而投的劍士們，這便是忍者的由來。

東洋的武士道由來已久，講究的是面對面的搏殺，對於忍者這種神出鬼沒，暗中傷人的戰法不屑一顧，而平時僱傭慣了武士浪人作為劍術指導的傳統領主們，一開始也並不喜歡這些靠暗殺吃飯的忍者。

但隨著戰亂無休止地進行，早期貴族式的戰法也漸漸地被廢棄，為