計劃，阻止他們的行動，劉師培才又逃過一劫。

汪公權被殺後，劉師培公開成為端方幕僚，為端方考訂金石，並任教於兩江師範學堂。劉師培徹底與革命黨人決裂。

1911年，劉師培隨同出任川漢、粵漢鐵路督辦大臣的端方入川。在保路運動中，端方因鎮壓運動被殺，劉師培也在資州被革命軍拘捕。辛亥革命勝利後，劉由孫中山保釋出獄。出獄後，劉經謝無量介紹，到四川國學院任教。劉師培後出任成都國學院副院長，並在四川國學學校兼課，講授《左傳》、《說文解字》等課程，又與謝無量、廖季平、吳虞等人發起成立四川國學會，著《廢舊曆論》等。

1913年夏，劉師培離開成都，他在《與成都國學院同人書》中稱自己本想在川兢兢業業，重振國學，無奈力不從心，加上疾病纏身，準備返回家鄉。然而，他並沒有回到家鄉儀徵，而是到了山西，擔任南桂馨家的家庭教師。後經南介紹，成為閻錫山的幕僚。

閻錫山看重劉師培的學問，將其推薦給袁世凱。在袁世凱稱帝的過程何中，劉師培不遺餘力為袁服務，曾任公府諮議、參政院參政等職，後又加入“籌安會”。1916年，他為袁世凱所寫的鼓吹帝制的《君政復古論》還沒來得及全文刊登，袁世凱便一命嗚呼。劉師培本被列入通緝名單，幸得李經羲擔保，他才免受牢獄之災。

【反目】

清朝末年，劉師培在上海結識章太炎，二人皆為古文經學家，對對方的學問很是推崇，又有共同的排滿倒清信念，故二人意氣相投，視為知交。因章太炎字枚叔，劉師培字申叔，二人被人合稱為“二叔”。

1907年春，在章太炎的邀請下，劉師培帶著母親、妻子何震和汪公權東渡日本。到日本後，章太炎與劉師培夫婦同租一處房屋合住，“三人同住一起，親密得像一家人。但是，不過兩個月，就吵得不可開交，章太炎不得不搬到《民報社》居住。”

劉、章關係決裂，據說因章太炎一次發現何震與其表弟汪公權關係曖昧，他替劉師培抱不平，暗中告知劉。結果劉師培反怪章多事。劉母也不相信此事，大罵章太炎居心不良，挑撥兒子兒媳夫妻關係。

據汪東說，何震因某些事情對章太炎懷恨在心，時常對劉師培吹枕邊風，劉師培聽信老婆的話，與章太炎反目。

無論如何，劉師培對章太炎決裂，此時他對革命黨人也很看不慣，在妻子何震和汪公權的攛掇下，有了投靠清廷之心。劉師培竊得章太炎私章，偽造《炳麟啟事》。何震還親自動手，給吳稚暉寫信，“揭發”章太炎為“反革命”。

在得知劉師培偽造啟事之事後，章太炎非常氣憤，他發表《特別廣告》，稱啟事為劉師培捏造，並揭發劉師培夫婦是清廷密探。劉師培夫婦也準備還擊，據說他們準備聘請律師，和章太炎打官司，後被人勸阻。為了洩憤，他們便到到章太炎寓所，將他痛打一頓。

接下來，有人在章太炎的茶壺裡面投毒，這便是轟動一時的“毒茶案”。後經調查發現，投毒者為汪公權。事情敗露後，東京留日學生界輿論譁然，強烈譴責劉師培夫婦。在此期間，日本政府應清政府的要求，查禁《民報》、《天義報》等報刊。劉師培夫婦在東京的處境很是困難，遂返回國內。

劉師培回國後，致函黃興稱，章太炎曾讓他寫信給兩江總督端方，只要端給兩萬元，便可捨棄革命宣傳，赴印度出家。隨信附有章太炎要他與端方聯絡籌款的五封信的影印件。劉師培此事並非空穴來風，當時章太炎對同盟會內部事務不滿，曾想出家，去印度學習梵文。因經費問題，曾先後求助於張之洞和端方，但最後此事作罷。1912年，章太炎在給浙江統一黨電報中澄清此事，稱當時籌款遊印，與革命活動無關。劉師培的信讓在巴黎的吳稚輝有了可乘之機，吳立即抓住這個機會，稱章太炎早已受清廷收買，擴大孫中山與章太炎的矛盾，致使同盟會由於內訌元氣大傷。

章太炎曾想挽救與劉師培友誼，但並未得到劉的諒解。1908年6月1日，章太炎曾致函孫詒讓，懇請孫調解他與劉的矛盾。他在信中說：劉師培“與麟同術，情好無間，獨苦年少氣盛，喜受浸潤之譖。自今歲三月後，讒人交構，莫能自主，時吐謠諑，棄好崇仇；一二交遊，為之講解，終勿能濟（以學術素不逮劉生故）。先生於彼，則父執也。幸被一函，勸其弗爭意氣，勉治經術，以啟後生，與麟戮力支援殘局，度劉生必能如命”。

劉師培出賣陶成章、張恭後，章太炎仍對劉師培抱有希望，他致書劉師培，稱其變節是受