本正式投降後，擺在暫時設立在橫濱的新的盟軍司令部面前的第一個問題，就是如何將日本軍隊真正復員。因此，1945年9　月2　日頒佈了總命令第一號。

該命令具體規定了由誰來接受日本各支軍隊的投降。日本駐在中國（除滿洲外）、福摩薩和北緯16度以北的法屬印度支那地區的軍隊，被命令向蔣介石委員長投降。

那些駐在滿洲和北緯38度以北的朝鮮地區以及柞太島的日軍應向蘇聯遠東軍總司令投降；太平洋各島嶼上的日軍向美國太平洋艦隊司令投降，駐東南亞的日軍向海軍上將蒙巴頓或向澳大利亞司令投降。帝國大本營和“日本本島及附近小島和北緯38度以南的朝鮮……與菲律賓”的所有日軍向麥克阿瑟將軍投降。他們要求日本交出完整的詳細情況的報告，大致排出移交各種軍事設318　備的時間表。飛機一律不得起飛，無論是海軍的還是民用的船隻一律停航。最後，日本當局應負責將戰俘和被拘平民安全交給最高統帥。

1945年9　月3　日頒佈了關於在日本某些地區設定盟國佔領軍以及具體指導日軍解除武裝和復員的命令。復員進行得非常順利、迅速，六星期內，日本本島的軍隊全部復員完畢。第一和第二復員局於1946年12月1　日取代了陸軍部和海軍部。這兩個局作為民間機構來負責完成日本海外武裝部隊的�