入太平軍營，廣置炸炮，這時是李鴻章部隊在沿江嚴密搜尋，徹底切斷其槍炮來源。這時候，朝廷對曾國藩的命令也益形急迫。盡是務須如何、不許如何、儘快如何、不可如何、萬勿如何、著即如何、不得稍存如何……這樣近於氣急敗壞的口吻。

戰事激烈，勝敗反覆。水師及陸軍的後勤、財政、武器製造、特務、軍法、調查所……種種事務至為繁雜，要保證出兵的接應，故曾氏也有辯解。保衛武昌時因出師不利，清廷憤怒譴責，其苦衷，有時又不惜言之諄諄，藉以倚裨，此中尤見“剿滅”難度之大。而最初，書生從戎，曾國藩也是在摸索中指揮戰爭。逐漸養成排程有方，軍略冠絕一時。大約打了三四年之後，才指揮裕如，如臂使指的。

而國藩之弟國荃，無論攻克哪座名城，幾乎都用地道轟裂之法。“公弟國荃晝夜圍攻，克此雄都。是為肅清東南之始”。甚至克復江蘇其他中小城市亦如此。收復南京，則用地道地雷轟炸，配備雲梯猛攻，開穴反覆達三十多道。終在1864年7月19日那天，“霹靂一聲，轟開城垣二十餘丈，煙塵蔽空，磚石如雨，賊以火藥傾盆，燒我士卒……群賊抵死巷戰”，戰況異常激烈。

曾國藩與其他大員的微妙關係，在來往函件中表達得淋漓盡致。如朝廷命李鴻章率�