戴季陶寫了《傷革命》一文，為陳其美抱不平：我們中國人的道德竟然墮落到這樣了嗎？共和已經建成了，但孫文也好，黃興也好，胡漢民也好，陳其美也好，都成了別人攻擊的物件。世界如此地沒有公理，只有強權；天下如此地沒有是非，只有成敗。整個世界都充斥著盜賊，我還有什麼話可說的呢！黃興辭去南京留守後，陳其美失去了南京的犄角之勢，不能不辭去都督職務。程德全得到了袁世凱的財政支援，於1912年7月31日到上海接收了滬軍都督府。於是，陳其美卸職下野，在一段時間內，躲在其表叔、湖州在上海的富商楊譜笙家裡，哪兒都不去，十分消沉。

革命黨人動員會黨參加革命，起義之後，會黨的破壞性處處表現出來，成為革命政府十分頭痛的一件事。和議成立，全國統一之後，會黨問題更顯得十分突出。上海都督府雖然因為財政力量和控制能力比較強，會黨成分的軍隊沒有譁變和搶劫，但這些人也不免志得意滿，花天酒地，招搖撞騙，敗壞了都督府的威信。孫中山於5月間在廣東發表演說，認為洪門（會黨的一支）原來是反對滿清政府的，是革命的先導；現在漢族已經光復，洪門就應該改變立會的方針，支援民國政府。他主張洪門應該把自己的秘密規矩公開化，進行改良，避免外界的猜忌，遵守法律，避免禍患，與社會和平相處，愛護國家，也為國家所愛。6月間，應桂馨很乖巧地順應政治人物改良會黨的願望，在上海發起青幫、紅幫、公口三幫組織共進會。他在致都督陳其美的呈文中說得很漂亮：“組織純粹民黨，實行取締會員，各處支部成立後，不準在外私開香堂、另立碼頭，剪除其舊染之習慣，免致與民國法律相牴觸。總期立圖改良，維持國內和平，增進國民道德。”也就是說，他要把會黨改組為合法社會團體。陳其美對共進會的成立表示支援，並在6月23日釋出的《中華國民共進會廣告》中列為發起人的首席。他後來回顧這件事說：當時我也贊助成立共進會，因為青紅諸幫，在革命時出力不少，把他們從黑暗的環境下引導到光明的世界，取名“共進”就是採取這一主義。7月1日，共進會開成立會，應桂馨任會長。但三幫並沒有取得一致，其他派系的人退出了共進會，共進會也成了應桂馨操縱的工具。應桂馨後來為共進會辯解說：“同盟會自合併國民黨後，即將從前分子之青紅幫等置之腦後……前清時共圖革命，今國民黨只顧自己做官，且反對青紅幫，故設會保護他們，使有法律保護。”話說得冠冕堂皇，也有部分實情。程德全為了安定社會，任命應桂馨為江蘇巡查長。後來，共進會轉移到浙江肇事，引起浙、蘇兩督政策分歧，惹下了很大的麻煩。宋教仁、陳其美也先後為會黨成員暗殺，會黨成員朝三暮四，非常不可靠，利用會黨的結果也損害了自己。會黨問題是一個很複雜的社會問題。陳其美利用會黨革命，只是一個突出的典型事例，在整個民國史上，有形形色色的各種故事發生。