轉眼過了三年。到了建初八年（83年），烏孫派往漢帝國的使者即將返回國內，漢章帝派衛侯李邑護送烏孫使者以及入侍漢帝國的烏孫王子返回國內。同時，漢章帝為了表彰班超在西域的重大貢獻，將班超擢升為將兵長史，將兵長史擁有調遣軍隊作戰的許可權，實際上是委任班超為西域的軍事長官，可以調動管轄下的西域軍事力量。同時，班超的副手徐幹由假司馬升為軍司馬。

此時距班超出使西域已經過了十年。對於班超的個人生活，史書沒有記載，但我們幾乎可以肯定，在四十歲以前的班超，還是一個單身漢，他娶妻是在到西域之後，他的妻子是誰，現在搞不太清楚，由於班超長年駐守在疏勒，因此班超妻子很可能是疏勒人，在這十年中，班超的三個兒子陸續出世，長子班雄，幼子班勇，次子的名字沒沒有留下紀錄。

在東漢與烏孫互通使節的這三年間，班超並沒有實力對龜茲發動強有力的反擊，畢竟他的基本部隊，除了跟隨他到西域的數十人之外，便是徐幹帶來的以囚徒和冒險分子組成為小部隊。龜茲也不斷地發兵攻打疏勒，但是沒並有多大的進展。

李邑護送烏孫使者透過塔里木盆地南道，到達于闐，得知龜茲軍隊又一次對疏勒展開猛攻，北上烏孫的路被截斷了。李邑不敢冒險透過，為了掩飾自己心中的恐懼，他上書皇帝，認為經營西域絕對不可能成功的，並且詆譭班超，說班超只知道“擁愛妻，抱愛子，安樂外國，無內顧心。”

班超聽說這事之後長嘆息一聲說：“我雖然不是曾參，卻遇到曾參的三至之讒，恐怕時人所見疑了。”於是忍痛休胡妻，以示對祖國的忠心。什麼叫三至之讒呢？這是曾參的一個故事，當時魯國有一個跟曾參同名的人，殺了人，有人跑去跟曾參的母親說，你兒子殺人了，曾母當時正在織布，她笑著說，我兒子怎麼會殺人呢？不理會；過了一會兒，又一個人跑來告訴曾母，你兒子殺人了，曾母仍然繼續織布，還是沒理會；又過一陣子，第三個人跑來告訴她，你兒子殺人了，這下曾母慌了手腳，扔了機杼，翻牆而逃。所以讒言多說幾遍，就成了真的了。班超心細如針，這種事，不能不防小人啊。

不過班超還算走運，倘若遇到昏君，恐怕此生心願難遂，還好他遇到的是漢章帝。章帝對班超非常的信任，也知道班超志向高遠，忠心耿耿，他看到李邑的上書後，十分不滿，下詔責備李邑：“縱使班超擁愛妻、抱愛子，這也是人之常情，倘若班超如你所說一無是處，他如何能使思鄉心切的一千多名部下，與之同心同力奮戰在絕域呢？”

看來章帝並不糊塗，他命令李邑前往班超處，受班超的節制，並且發給班超一份詔書說：“如果李邑適合在域外工作，你便把他留下來。”

班超並不想留下李邑，當時因為龜茲人正在發動進攻，北行的通道被阻斷，班超便命令李邑護送烏孫國的王子返回洛陽。

軍司馬徐幹勸班超說：“李邑這個人，在皇上面前詆譭你，想要破壞我們在西域的事業，要是讓他回到首都，豈不是更有機會說你的壞話嗎？我看還是把他留在西域穩妥一些，另遣其他人護送烏孫王子回洛陽，這樣不是更好嗎？”

班超搖搖頭說：“此言差矣。李邑詆譭汙衊我，這種人要是留在西域，成事不足，敗事有餘，不如遣他回京，省得日後為患無窮。超自認為問心無愧，何懼人言？倘若只是為了報復，硬把李邑強留在西域，不是忠臣所為。”

唉，英雄固寂寞，連喚取紅巾翠袖，都不免被流言飛矢所傷，更誰來搵英雄淚！

漢章帝的信任與支援，是班超開拓西域事業的堅強後盾。章帝元和元年（84年），東漢政府再度增兵西域，由假司馬和恭率領一支八百人的小分隊，支援將兵長史班超。這時班超手中的漢軍數量增加到約二千人，雖然數量仍然偏少，但是班超已經準備對反叛的莎車國展開攻勢了。

然而這次，疏勒王忠突然叛變，使班超遭遇到十年來最大的一次困難。

班超在得到和恭率領的八百人援軍之後，又徵發疏勒與于闐的軍隊，進攻莎車國。莎車國位於疏勒與于闐之間，兩面受敵，頗為狼狽。莎車王秘密與疏勒王忠聯絡，以大量的金銀財寶賄賂疏勒王，疏勒王在得到這些財物後，臨陣反戈，撤出戰鬥，退保疏勒西部的烏即城。

疏勒曾為龜茲的奴僕國，正是班超驅除龜茲人的勢力，立忠為疏勒國王，而且這些年來，班超始終與疏勒國一同抗擊龜茲人的入侵。疏勒王為什麼會叛變呢？這裡還有更深層的原因。

最根本的原因，恐怕是