582年五月，突厥大舉南侵隋朝。沙缽略大可汗攝圖，帶領達頭可汗玷厥和阿波可汗大邏便，率領四十萬突厥兵士，兵分兩路進攻隋朝。

大邏便帶領十五萬突厥兵士，直接南下攻向涼州。涼州總管獨孤羅，嚇得直接棄城逃跑，涼州城一下子就淪陷了。大邏便佔領涼州後，派二萬人留守。他帶領十三萬突厥兵士繼續南下，在樂都城外十里的乙弗泊，與馮昱帶領的一萬隋兵遭遇。一萬隋兵在突厥數萬騎兵的衝擊下，死傷殆盡，只有不足兩千逃入了樂都城。馮昱大敗後，龜縮在樂都城不敢出來再戰。大邏便帶領突厥兵士繼續向東前進，在蘭州城外二十里，與蘭州總管叱列長叉遭遇。叱列長叉帶領的三千臨洮守兵對戰數萬突厥騎兵，死傷大半，滄皇逃回臨洮，不敢出來再戰。大邏便帶領十二萬突厥兵士繼續向東前行，迅速包圍佔領蘭州。

蘭州城兵民頓時大亂，守城兵士投降，大邏便手下十二萬突厥兵士衝入蘭州城，到處搶掠，不管人畜，一概搶走，就如群狼過境。雞鳴狗叫人喊馬嘶，聲聲不絕。突厥兵士肆意對城中女子姦淫擄掠，女子紛紛上吊、撞牆、跳井，悲哭哀嚎之聲震天。城中男子拿起菜刀，拿起鋤頭，拿起木棍，反抗突厥人對自家的搶掠。他們紛紛被突厥人砍翻在地，身首異處，血流成河。蘭州城被抓的年輕女子，青壯男子，像牛羊一樣被綁著手，驅趕前進，城中處處冤聲動天。蘭州城頓時變成了一幅地獄景象。

突厥兵士看著這幅景象，反而高興壞了。他們一下子有糧食，有錢財，有牲口，有絲綢，有女人，有奴隸，來隋朝搶掠一趟真是大有收穫。突厥人聽著各種哭喊哀嚎之聲，簡直是人間極樂，這才是隋朝那些豬羊般低賤的人，見到他們應該發出的聲音。看著隋朝人痛苦的哀嚎和驚恐無助的表情，他們如飲美酒般舒爽，這才是突厥勇士能得到的最高享受。

孫思邈躲入事先挖好的地窖中，他也不敢妄動，外面可是密密麻麻的突厥人。這個地窖空間足夠大，裡面還藏著各種物資。孫思邈在得到突厥即將進攻蘭州的訊息後，就悄悄的囤積物資，將身上的錢全花了出去。說來這還要感謝聖女，她帶來了準確的訊息。如今糧食和肉乾，在地窖內都堆滿了。地窖上面也堆滿了各種成捆的藥材，突厥兵士查過，以為是堆柴火的雜物間，並未細細翻找，讓孫思邈成功的躲過了這一劫。

小葉帶領的巫聖教手下，在突厥人佔領涼州時，就經由巫聖教挖好的密秘地道，逃出了蘭州城。聖女也早就離開了蘭州城。

還有一些見勢早，反應快的人也紛紛逃離了蘭州城。而那些捨不得身家、捨不得官位、捨不得榮華、捨不得富貴的人，都沒能逃出蘭州城。

蘭州城大小官員都主動投降了突厥，向突厥人卑躬屈膝，他們開啟糧倉，開啟府庫，任由突厥人將蘭州積累的財富，搶掠一空。最終他們還是成為了突厥人的階下囚，被擄去了突厥。

突厥人在蘭州整整搶掠了三天，將能搶走的東西全部帶走。蘭州城一下子變成了一座空城，突厥人這才滿意的離開了，前往下一座城，繼續搶掠。

孫思邈發現突厥人走遠了，這才從地窖中鑽了出來。他馬上背上行醫袋，他要用最快的速度，衝進每家每戶，去搶救還活著的傷員。當他來到蘭州城的大路上，看了一下東南西北，竟然連一個人影都沒有，整座蘭州城死氣沉沉。

孫思邈看到的景象是無比慘烈的，根本不像他原先預想的那樣有很多傷員。因為他看到的基本上都是無頭的屍體，有的甚至被剁成肉泥。有的屍體衣服都被扒光了，女屍更加是慘不忍睹，基本上都被突厥人強暴了，有的更是滅絕人性的在下體塞了根木棍。孫思邈心想：“這就是戰爭嗎？彼此都用最殘暴的方式對待對方，沒有一點人性，沒有一點悲憫。”

孫思邈將那些上吊的女子取了下來，將那些跳井的女子撈了上來，將那些撞牆的女子身體擺正，全部一一給她們探脈摸氣，只要還有一口氣，他都會全力搶救。所到過的每家每戶，亦仔細翻找，看有沒有幸存者。

孫思邈三天三夜，不眠不休，跑遍了整個蘭州城。最終搶救下來了四十八個孩子。整個蘭州城近十萬人口，僅僅剩下了四十八個人還活著，加上自己也不到五十個人。四十九個人，這就是這次蘭州浩劫的倖存人數。他們有的是躲在地窖裡，憋了幾天；有的躲在茅草裡，一動不動忍耐了幾天；有的躲在火灶內，忍受著高溫和燒傷；有的躲在水缸裡，面板都被泡爛了；有的是上吊未吊死的，也只剩最後一口氣了；有的是撞牆未撞死的，昏迷了幾天；有的是跳井未淹死的，也