分成35支裝備戰機規模不等的合成化部隊。從這一點看，和後世空軍進行的師改旅多少有些相像。

第二個階段，從1995年起到20世紀末。

現行的軍區空軍將不復存在，取而代之的是航空軍，成立12支航空軍，管轄航空聯隊。航空軍定位正軍級，下轄2…6個航空聯隊。航空軍是空軍實現戰區戰略、遂行戰役作戰的基本軍團。平時接受駐紮地軍區和空軍司令部領導，戰時歸戰區聯合指揮部指揮。

於是就開始向指揮體制的改革轉移。

在這個階段裡，空軍要重組機關組織機構，減少指揮層次，裁撤機關人員。首先是各級指揮所被撤銷，將全國領空劃分為五個大區域，設立五個區域空軍司令部，分別為中央空軍司令部、西北空軍司令部、西南空軍司令部、東南空軍司令部和華南空軍司令部。

區域空軍司令部是空軍司令部的下級指揮機構，司令部參謀長從航空軍軍長之中挑選，同時兼任所在軍區的軍區副司令員，等同於原來的軍區空軍司令員。

這五個區域空軍司令部分為是設立在首都軍區的中央區指、西北軍區的西北區指、西南軍區的西南區指、東南軍區的東南區指和華南軍區的華南區指。這樣也變相地提高了這五個軍區司令員的含金量。

從區域劃分來看，空軍區指都是設立擁有較長邊境線的軍區。東北軍區因為緊鄰著首都軍區，所以沒有設立區指。華中軍區因為本身戰略預備隊的身份，所以也沒有設立區指。

區域空軍司令部下設有指揮控制中心，實際上就是兩套牌子一班人馬。區域空軍司令部沒有人事權，沒有管理權，只有指揮權。也就是說，當航空部隊的戰機升空之後，他們才有權利指手畫腳。戰機和飛行員在地面，他們管不著。說