實在不行自己發動一場資產階級革命也不是什麼大不了的事兒，以現在護衛隊的武力，南京附近的軍隊都不夠看。

早在六月中的時候，梵蒂岡的主教任命就到了：任命鄧玉函為台州大教堂的主教。本來梵蒂岡想派個職業主教過來，但是因為趙永泰的限制條件，梵蒂岡只能暫時就近任命一個。隨船而來的還有15名新派過來的傳教士。

雖然梵蒂岡的任命來了，但是因為此時朝廷正在注意著合興泰，所以大教堂的建設被推遲了。現在傳教士們對這裡都很喜歡，而且趙永泰已經同意他們在這裡傳教了。來了大明多年，他們對大明的政府也有所瞭解。所以在趙永泰解釋了之後，大家也沒有提出抗議什麼的。再加上對他們來說，現在每天的工作和傳教已經佔用了他們的大部分時間，他們暫時也沒有足夠的時間來設計建造這座大教堂。

七月中，在確認了皇帝的注意力徹底移開了之後，趙永泰召集了台州所有的傳教士和教徒，宣佈開始建造台州大教堂。現在在臺州的已經有了6名傳教士，第二批3人是在三月初抵達的。得到訊息的傳教士們擠出了大量的時間來設計這座東方的第一座大教堂。合興泰給他們劃的地在城西30裡處，雖然有點兒偏，但是足有十畝，傳教士們都很滿意。

八月底，第三批傳教士5人也到了台州，他們是在天主教中國教會知道台州開始正式修建大教堂之後召集的在華人員，其中就有湯若望。趙永泰對湯若望的熱情讓其他人都很奇怪，不過這總是一件好事不是嗎。傳教士對此很高興：這位在臺州很有地位的少年與鄧玉函、湯若望親近，那他們以後的傳教工作就能更順利。

因為在臺州的傳教士人數達到了26人，還有不少的中國教徒。所以在九月，趙永泰要求所有傳教士加入書院，並改組書院的術理分院為物理分院、化學分院和生物分院。三個近代主要科學門類正式在東方確立。

經過幾年的規劃調整，仙台書院已經開始轉型為一個正式的書院。書院的教室和宿舍低價提供給在書院的求學人員和教員，其他人員則需要提供高額的租借費用。現在書院的正式學員已經突破了一千人，教員超過一百人。書院的數學、醫學、術理分院在江南地區已經頗具名氣。

書院實行三、六年制，正常畢業為三年，如果三年不能畢業則推遲到六年。六年後還不能畢業則被強制結業。書院畢業人員可直接加入合興泰商行，這一點兒是吸引不少學子正式加入書院求學的主要原因之一。明智學堂畢業學生從崇禎元年九月開始，可繼續就讀於書院中除經書以外的所有分院。

李時珍的兒子李建元在崇禎元年八月加入了書院的醫學分院。在此之前，趙永泰以書院的名義宣佈將以《本草綱目》為基礎加入西學以著出更加系統詳細的醫學著作。此舉吸引了不少民間的名醫加入。

九月，趙永泰以方便醫學分院學員實習的名義，建立了仙台杏林醫館。醫學分院的教員和高年級學員都要到館裡輪值。由於醫館的收費低廉，受到平民百姓的青睞。後來因為名氣越來越大，也漸漸有一些富戶到醫館求醫。

一開始，各地慕名前來的中醫與傳教士中的西醫互不對眼，基本上沒什麼交流。看得趙永泰很是鬱悶：我成立醫學院和醫館就是為了讓你們交流，你們現在連話都不說，那交流個屁啊。後來他想了一個辦法，在醫館的正堂貼了一張大大的評比表，將每名醫生的大名都列在上面。這名醫生醫好病人就在其名字下面用硃砂寫正字，沒醫好就用墨寫正字。統計資料在每個月月底的分院大會上進行通報。並以此作為每月的獎金髮放標準。

這樣來刺激雙方的比鬥情緒。只有在鬥起來了之後，雙方才能發現對方的優勢和己方的弱勢。而後就可以以開會或者其他形式來要求他們進行交流。一旦開了頭，以後就好辦了。

一開始，找西醫看病的人基本沒有，大明的老百姓還是相信自己國家的東西。要不是還有幾個教友找他們，他們在前兩個月的成績就會是零。在連續兩個月被學員們以異樣的眼神看待後，幾個西醫終於決定不再等待，要主動出擊。就開始在醫館門口攬客，這樣一來把看病的人更嚇著了，哪有人聽說大夫會在門口逮著人要求看病的，肯定是騙子。結果招攬了幾天，幾位西醫還是沒有一個人接到一位病人。

直到有一天，一名工匠不小心腿被砸斷了，前來就醫。幾位坐堂的中醫都說這腿肯定廢了，要病人和家屬做好心理準備。結果一直在一旁觀看的菲利普斯大喜過望，跑出來跟那個傷著說他們能夠幫助他，雖然不一定能夠恢復原樣，但是至