三桂留鎮雲南後，已有在當地做“雲南王”的打算，正是他的不斷懇請，才使得北京清廷下決心把永曆帝捉到手。

本來，永曆帝竄入緬甸窮荒僻遠之地，清廷已經認定他是不可能復燃的死灰，準備放棄征剿。

吳三桂不依不饒，急忙呈上《三患二難》之疏，非要清廷擒拿永曆帝，殺之而後快。所謂“三患”，吳三桂詳述如下：

“　夫永曆在緬，而偽王李定國、白文選、偽公侯賀九儀、祁三升等分駐三宣六慰、孟艮一帶，藉永曆以惑眾心，倘不乘此天威震赫之時，大舉入緬，以盡根株，萬一此輩立定腳跟，整敗亡之眾，窺我邊防，奮思一逞。比及大兵到時，彼已退藏，兵撤復至，迭擾無休，此其患在門戶也。

土司反覆無定，惟利是趨。有（如）我兵不動，逆黨假永慶以號召內外諸蠻，餌以高爵重祿，萬一如前日沅江之事，一被煽動，遍地烽起，此其患在肘腋也。

投誠官兵，雖已次第安插，然革面恐未革心，永曆在緬，於中豈無繫念？萬一邊關有警，若輩生心，此其患在腠理也。〃

所為“二難”，吳三桂詳盡說明：

“今滇中兵馬雲集，糧草問之民間，無論各省銀兩起解愆期，難以接濟，有銀到滇，召買不一而足。民室苦於懸磬，市中米價巨增，公私交困，措餉之難如此也。凡召買糧草，民間須搬運交納。如此，年年納，歲歲輸，將民力盡用（於）官糧，耕作半荒於南畝，人無生趣，勢必逃亡，培養之難又如此也”。

所以，吳三桂得出結論：

〃臣徹底打算，惟有及時進兵，早收全域性，誠使外孽一淨，則邊境無伺隙之患，土司無惶惑之端，降人無觀望之志，地方稍得蘇息，民力稍可寬舒，一舉而數利存焉。竊謂救時之方，計在於此。謂臣言可採，敕行臣等尊奉行事。〃

清廷下定決心後，撥銀數百萬兩，指派內大臣愛星阿率一隻八旗勁旅，親赴雲南，配合吳三桂進軍，以圖全力剿滅西南一帶的南明殘餘勢力。

緬甸新土王正氣憤從永曆帝那裡得不到賀禮，同時接到吳三桂等人發來的恐赫信（先前�