稱“監國”（代理皇帝）。三天後，清軍殺到，一直被寄予厚望的潞王與屬下沒做任何抵抗，向清軍獻城投降。

此前一天，朱聿鍵已離開杭州。潞王被俘訊息傳來，黃道周等明臣上疏勸朱聿鍵監國。在鄭芝龍家族擁護下，朱聿鍵在建寧（今福建建甌）稱監國。二十天後，他在福州正式稱帝，改元隆武。舉行大典儀式當天，大風霧起，拔木揚沙，尚璽官的坐騎受驚，玉璽摔落，碰壞一角。雖然兆徵不祥，隆武君臣還是很有平復天下的決心，銳意恢復。

由於身世坎坷，隆武帝和弘光帝迥然不同，他善於撫慰群臣，樂於納諫，甚至同意招納“大順軍”（李自成軍）餘部，以共同抵抗清軍。同時，針對南明軍殺害剃髮的平民一事，他也予以阻止：“兵行所至，不可妄殺。有發為順民，無發為難民。”這一諭旨使得一般百姓歡呼鼓舞，紛紛來投。

雖為英明之主，隆武帝卻一直為鄭氏集團所架空。以鄭芝龍、鄭鴻逵、鄭芝豹、鄭影為首的鄭氏家族，都是大海盜頭子出身，數十年橫行福建、廣東、浙江一帶沿海，兼商兼盜。他們崇禎初年受招安後，趁天下大亂之際一直忙於擴大地盤，充實實力。

鄭芝龍等人推舉隆武帝，其實也是看上了這位爺“奇貨可居”，朝中一切實權都掌握在鄭家手裡。

鄭芝龍從小就不是好貨，不到二十歲，就因為勾引後媽被父親驅逐出家門為盜。鄭家惟一的忠臣，只有一個鄭成功。鄭成功原名鄭森，是鄭芝龍和日本老婆生的兒子。鄭芝龍有一次帶鄭成功入宮，隆武帝見之大悅，以手撫其背，說：“恨無一女配卿，