策劃孫立人的風山軍　官訓練班併入軍校中，陳系的林蔚、郭幃、羅卓英等企圖將孫的　練兵權轉到羅卓英手上，都沒有成功。1949年9月，蔣介石為　取得美國的積極援助，又提拔孫立人為“臺灣防衛總司令兼東南　軍政長官公署副長官”。但在陳誠“公署長官”的控制下，孫實　際上是空頭司令。

蔣介石在到臺的前幾年，要向美國作出姿態，用“親美派”　孫立人，但都置於他的心腹控制之下。在蔣氏父子看來，軍隊是　生命線，孫立人為抓軍權，早在1949年就和美國勾結。當時，　麥克阿瑟曾派專機將孫立人接到自己駐日本公館中密談。據孫事　後向蔣介石彙報說，密談的內容是：美國為使臺灣這艘不沉的航　空母艦不落於中共之手，有意讓孫負起保臺的責任；美國全力支　持，要錢給錢，要槍給槍。對國民政府已不抱多大希望。孫對麥　克阿瑟的答覆是，他忠於蔣介石，不能臨難背棄，自己必須在蔣　指導下挑起保臺重擔。蔣介石性情多疑，對此話既信又疑。

在孫立人接連晉升之後，蔣氏父子風聞美國已考慮對臺灣實　行“換馬”，在美國留過學的孫立人是“上馬”的最佳人選。這些不管是真是假，都足以引起蔣介石的警覺。美國人之所以看中　孫立人，雖然有多種原因，但主要的一條是對蔣的絕望。打仗要　用兵，美國“用亞洲人打亞洲人”的策略需要亞洲人，而在臺　灣，兵力是蔣介石最後一張“王牌”，不管這些破銅爛鐵是否管　用，總比沒有強，因此美蔣之間，便環繞爭奪軍權的磨盤團團打　轉。美國意圖驅蔣，而驅蔣的本質只有一個，就是要更直接地插　足臺灣，將臺灣獨立出去，變現在的半佔領為全部佔領。這正是　毛澤東所擔心的、所說的為何不傾向“親美派”代替蔣介石。

據說孫的學識超群，這在中國的特殊情況下，變成他的負　數。孫的一位老部下就說過一句很概括的話：“孫是個非常優秀　的帶兵官，但是位很壞的領袖。”就是說他的人際關係非常差。　和他的同輩，幾乎無人可以合得來。任“陸軍總司令”期間，每　周軍事彙報，他從未準時出席，其理由十分可笑：“他不願意向　周至柔總長敬禮，遲到能避免，因為，總統已在場。”

孫之傲慢，固有其理由，主要看不起他的一些同僚，認為自　己鶴立雞群，再加美國的崇尚，又有戰功，似可無敵於天下，然　而他常常孤立無援，且遭致群體的打擊。他又和吳國楨有某些類　似，和小蔣為敵，以“陸軍總司令”的地位，抑制蔣經國的政工　制度。

1950年12月，孫立人召開一個“良心會”，讓許多高階長官　來聽取士兵的良心話。孫致詞說：“現在社會黑暗，人心不古，　不但做事騙人，說話也騙人，所以社會動盪不安，就是彼此不能　開誠相見，埋沒了良心之故。”蔣經國覺得，孫立人撈過界，這　本來是該“政治部”份內的事，蔣經國反擊，推行“慶生會”，　孫、蔣較量的火藥味，乃全面擴散。

美軍顧問團長蔡斯，他是帶了支票簽字權的美國大亨，負責　臺灣的軍援執行，頤指氣使，法力無邊，早為蔣介石父子所不　滿。孫、蔡不謀而合，蔡斯也主張撤消軍中政工制度。蔣經國疑神疑鬼，遷怒到孫的頭上，認為孫假外人以自重。於是蔣介石密　令除奉命者外，任何人不準與蔡斯接觸。1954年6月，孫立人　在臺灣的軍事改組中因“任期屆滿”理由免去了　“陸軍總司令”　職，改任“總統府參軍長”，貶為閒曹。孫對此很不滿意，發牢　潁�擔骸跋衷諤ㄍ迨橋�磐持穩瞬擰！彼�虢杞郵苊攔�樟炙苟俅蟆⊙Ц��こ灘┦墾�晃��ッ攔���槭�┛炙�矯攔�蟪晌�　拔夤�宓詼�保�從枳夾懟５��朔笱苊攔�突漢退鐧姆炊裕�恕√嵐嗡鐧那仔龐嗖��巍案輩文弊艹ぁ薄＞」莧鞝耍��細缸尤浴【醯盟鋃浴巴醭�庇星痺詰耐�玻�豢傘把�⒁嘔肌薄�

1955年5月底，臺灣當局抓到一個名叫郭廷亮的“匪諜”，　稱其“為中共工作”。該犯是孫立人部隊的少校營長，據說利用　與孫多年長官部屬關係，在軍中聯絡少尉級軍官100餘人，預備　於適當時機發動兵變，擁戴孫立人為“臺灣元首”。於是，孫立　人便被指控為兵變事件的後臺。3月，臺灣當局公佈了孫立人的　“辭職書”，並組織了　“調查委員會”，對孫進行偵訊，羅列了諸　多“罪行”。最後，由蔣介石出了一具手令，說孫立人“久歷戎　行，抗戰有功，且於該案發覺以後，即能一再肫切陳述，自認咎　責，深切痛悔，茲特准於自新，毋庸另行議處，由國防部隨時察　考，以觀後效”，從此，孫立人被軟