當然這些也還都是屬於商業範圍內，由商務司來管，也說得過去，但隨著商毅勢力的發展，不管是否宣佈自立，早晚都會對外建立官方的來往，如果還是由商務司來付責這些事情，就形得有些不倫不類了。

另外由於商家軍是一支以使用火器為主的軍隊，加上商毅應用了一些新技術，使浙江地區的開礦、冶金水平和規模也都有了長足的發展，不僅開設了一家大型的冶鋼廠，同時還需要大量進口各種金屬礦產，這也是浙江地區的主要進口物資，因此現在開礦、冶金也成為一個速度發展的產業。目前開礦和冶金事務還是歸屬於工建司管理。

和冶金、開礦道理相同的是紡織業，現在的浙江出口的商品中，紡織產品佔了相當大的比重，包括絲綢、刺繡、綿布、生絲、紗等等商品，而浙江地區的工廠、手工作業也有一半以上都與紡織業有關，因此紡織業也成立浙江地區的第一大支柱產業。而所有紡織業都屬商業部管理，顯然有些不合適了。

在這種情況下，現有的這九個部門顯然是己經無法滿足於發展的需要，因此商毅也決定，增設工業司、對外貿易交流司、礦產冶金司、紡織司這四個部門。

工業司付責管理各工廠、手工作坊的生產事務；礦產冶金付責管理開礦、冶金等事務；紡織司付責與整個紡織行業有關的各種事務，而對外司則分為兩塊，一塊付責對務貿易，另一塊付責對外交流來往，因為現在對外主要還是貿易來往，商毅暫時還用不著一個外交部，等以後條件成熟之後，再進行分離。

但凡事有利就有弊，部門分得細了，雖然可以使管理更方便，更專業，也更直接，但也出現了一些新的問題，不少事情需要幾個部門同時管理，比如一個鍊鋼廠，因為這既是工廠，又有商業行為，首先要在工業司和商業司註冊，同時鍊鋼又屬於冶金行業，因此又要經過礦產冶金司批准，如果要進口礦石，側還要透過對外貿易交流司，再加上完稅需要的財政司，建廠房又需要透過工建司，因此前前後後一共要和六七個部門打交道。

一個絲綢廠也是一樣，雖然不用和礦產冶金司打交通，但又多了一個農業司，因為織造絲綢要種桑養蠶。雖然不像後世那樣，一件事情要跑十幾個部門蓋章，但也比過去要麻煩得多了。因此商毅的這個提議也遭到了一些人的反對和質疑，也有人認為可以只成立工業司、對外貿易交流司這兩個部門，而礦產冶金司、紡織司則可以先掛在商業或工業司下面，先觀望一段時間再說。

不過商毅也知道，世界上不存在絕對完美無缺的制度，隨著生產社會化，分工會越來越細，而管理也會越來越細，這也是大勢所趨，想拒絕這種發展趨勢是不可能的，只能從提高各部門的辦事效率上著手解決。因此也不厭其煩，向眾人反覆說明增設這些部門的道理。

但儘管如此，在最後投票的時候，還是隻通了成立工業司、對外貿易交流司這兩個部門，而礦產冶金司、紡織司則被否決掉。

當然如果商毅一定要硬行，也可以利用自己的威信影響，強行透過成立這兩個部門，但從維護投票制度的角度出發，也就順應眾人的意見，收回了自己的方案，並且立刻拿出一個備選方案，即變冶金司、紡織司為冶金所、紡織所，冶金所將歸屬在工業部下，而紡織所則歸屬在商業司下。

這一點到是得到眾人的同意，因為眾人也都清楚，從現在的發展情況來看，冶金業和紡織業也確實需要有專門的組織來進行管理，這一點在過去的明朝也是一樣。因此也得到了透過。

當然這些事情，並不是在一天透過，而是經過了三天的時間，進行了無數的討論、爭辯，說明解釋，總算是對商毅集團下一步的發展，以及行政組織結構都制定了一個明確的目標。

而在會議的最後，商毅也正式宣佈，在以後的主要行政決策時候，都用這種無記名投票的方式來解決，做為一種正式的決策制度保留下來。

同時商毅也制定出無記名投票的暫行制度：

一、投票方式為無記名投票，內容包括“同意”“反對”“棄權”三種，任何決意都必須超過半數的有效“同意”票，才能夠獲得透過。而某些重大決策，則需要超過七成有效“同意”票，才能夠獲得透過。

二、參與投票的人由目前成立的十一個部門主事，再加上屬於行政司的周士奇、王夫之、李巖、以及商毅或葉瑤瑱，一共是固定十五人，另外在某些重大決策方面，還有可能邀請一到兩名相關人員參與。而商毅或葉瑤瑱則允許投出兩張票。這是他們唯一的特權。