後的歷朝都會制定本朝的法律，並且成立專門的法律部門和一定的法律程式，對於這一點，包括秦漢以後所有的儒家學者都沒有任何的意義。因此和世界其他古文明國家相化，中國古代的法律其實是相當先進而完善的，其他古文明國家，包括古印度和古歐州，在很長一段時間裡，都是以宗教的經典為基礎制訂法律，甚致一度以宗教審判所一類的機構作為執法機關。

但中國古代的法律也存在著相當大的缺陷，排除歷史侷限的因素之外，中國古代法律最大的缺陷就是，在法律上以刑法為中心，兼有民事、行政和訴訟等方面的內容，實際是將多種法律形式混合編纂成一體。而在執行上，雖然在中央有專門的執法機關，但在地方上，卻是由行政機關兼理司法。即各地的知府、知州、知縣實際就是最高法官，併兼審理、判處於一身。

在這方面最典型的例孑就是民間傳說的包公，老包同志的實際官職是開封府府伊，實際就是一個市長，同時還兼任開封公安局局長，開封法院的院長，即管民事，還管刑事，也管訴頌，既可以偵案、查案，同時還有審案、判刑的權力。

儘管後來各朝也意識到這一點，也在加強地方的司法機構，宋朝在地方上設成了提型點獄使，明朝也在省一級機構設立了按察使，在府、州、縣也設立了掌管刑法的官員，但行政機關和司法始終洠в忻魅販摯�Ｄ橋戮褪竊謔∫患叮�床焓掛慘�苧哺�慕諡啤６�庖惶逯疲�恢憊嘰┳耪�鮒洩�姆飩ㄊ貝�崾��龐興�謀洹�

在這一方面，中國古代的法律和歐州古代的羅馬法糸相比，就要遜色不少，儘管在古羅馬帝國之後，羅馬法系也受到了宗教的極大影響，但是羅馬法糸中：公民在私法範圍內權利平等原則、契約自由原則、遺囑自由原則、“不告不理”、一審終審原則等，權利主體中的法人制度、物權制度、契約制度、陪審制度、律師制度等都已經深入人心，近現代的歐美各國建立的法制中，有許多原則和制度，都是採用自羅馬法糸。

另外在審判定刑的程式中，中國執法機關是以疑犯的口供為第一，而羅馬法系則是按口供、人證、證據、事實等各方面並重的原則。

而且在這個時代，歐州各國的法律也在逐漸脫離宗教的影響，吸取羅馬法系中的優點，重新建立各自的新法制，按另一時空的程序，在三十多年以後，英國將釋出【權利法案】，在一百多年以後，法國發布的【拿破崙法典】，都將使各自的法制大大提高。

因此中華帝國的司法部成立之後，商毅同時也決定，將在各省、府、州、縣，都成立各級的司法部門，設立各級後法院、檢查院、公安部等執法、審判機構，而且都是權力獨立，直接對上級的司法部門付責，不受地方行政機關的控制。

雖然商毅制定的司法體系，和中國古代歷朝的司法體糸有很大的不同，因此在提交給國會之後，也引發了非常激烈的辯論，不過在這個時候，商毅多年以來建立起來的巨大的威信力發揮了最重的作用，當然在另一方面來說，三權分立是建立國會的時候，就己經確定好的大原則，而且把司法從行政機構徹底分離開，進一步削弱內閣的權力，對國會來說，並沒有損失，相反還能鞏固國會的地位。

另外有不少頭腦靈的國會議員心裡都能夠算清這筆帳，國會的制度就己經決定了，國會本身只能有立法權，而不能有執法權。一但執法權被內閣掌握，國會將很難與內閣相抗衡，因為從理論上說，內閣可以非常容易的利用司法機構，將不聽話的議員一一清除掉，因此只真確立三權分立，把執法權從內閣分離出來，形成三方互相的權力制約，才是對囯會最有利的。

因此最終的投票結果，雖然贊成票不足六成，但新的司法體制，仍然還是在參、眾兩院透過。商毅提名以前的刑部尚書王仲平出任第一任司法部長，也得到了國會的透過。

而商毅也終於鬆了一口氣，司法體制得到了透過，這不僅是中國歷史上首次將司法機構比較徹底的與行政機構分離開，在法制建設上的一個大進步。同時也標誌著三權分立的國家結構終於完全建立了起來。可以說近代的國家制度，己經在中國初步確立，而中國終於跨過了這個歷史的十字路口，徹底走上了一條正確的軌道。

當然歷史的發展並非是直線前進，也許在自己之後，中國還會發生反覆，甚致出現倒退回封建zhuanzhi的時代，但歷史的發展程序是誰也擋不住的，這扇門巳經被商毅推開了，這條道路也被越來越多的中國人發現，相信就算有人還想再把中國拉回到以前的道路，最多也只能得呈一時