也被朱由崧當殿批准。

在後世的一些說法，都認為這是史可法的又一個大失誤，輕易的就賦予了四鎮兵權以及行政權力，終於釀成了武將擁兵自重，不尊朝廷的局面，而自己又輕率的離開南京的政治中心，將朝廷的大權拱手讓給了馬士英。

但從當時的情況來看，這也是不得以的事情，首先由於在朱由崧登基之前，史可法寫給馬士英的那封數朱甴崧“七罪”的信被馬士英交到朱由崧手裡，做為打擊史可法的實證，因此史可法也清楚，自己留在朝中，也難以取得朱由崧的信任，而四鎮都各掌重兵，又立有擁立之功，肯定是要給予實質性的獎勵，就算史可法不提，馬士英也會提出，那還不如由史可法主動提出來，對四鎮加以籠絡，然後自己在督師江北，如果能夠收伏四鎮，也是達到削減馬士英羽翼的目地。而且朝廷的大部份位置都被東林黨人佔據，就算史可法離開南京，東林黨也能控制得住局面。

江北四鎮設立之後，南明還有其他三股武將的勢力，為湖廣的左良玉、廣東的鄭芝龍和浙江的商毅。弘光朝廷加封左良玉為寧南候，駐守九江、轄湖廣之地，加封鄭芝龍為安南伯，駐守廣東，其弟鄭鴻逵為靖魯伯，駐守鎮江，部將鄭彩為總兵分管水師。但怎麼加封商毅，卻讓馬士英覺得很難辦了。

現在商毅的勢力範圍是浙江，這也基本得到了弘光朝的認可，因為商毅帶回了崇禎的遺詔和玉璽，無論馬士英怎麼不願意，也要對他加封，但商毅已經是掛將軍印的總兵，又是臨邑候，如果再向上封，只能晉公爵或是出任南京五軍督都府的職務，再不就是加三公一類的虛銜。

但這三個方案都難讓人接受，出任南京五軍督都府的職務，就意味著商毅要進駐南京，馬士英是萬萬不能答應的，而另外兩項，除了在明朝開國期間，還從來沒有過那個武將能夠獲得這樣的殊榮，就連戚繼光也在晚年以後，才獲得一個加封少保的虛銜，連封候都洠О鏡劍�虼司褪且恍┣閬蠐誚幽繕桃愕畝�值橙耍�郵懿渙松桃閼餉茨暱峋徒���簦�蚣尤��煥嗟男橄巍�

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當然這也是商毅私下裡向吳��岢齙囊�蟆Ｉ桃悴⒉輝諍跏裁蔥槊��鷀凳欠飧齬���褪欠饌跤幟茉趺囪�兀繘＇有一點實質性的作用。自身的實力才能決定一切，當初商毅帶兵南下，只不過是個參將，像當時劉佐良、黃得功這樣的總兵，還不是老老實實聽他的。

因此在官位上，商毅其實更看重浙江巡撫一職，因為巡撫才是可以主管一方的軍政財大權的官員，雖然浙江是商毅的勢力範圍，但實際受他控制的，只有五六個府，對其他地方的控制力量還不夠，這也是商毅要驅逐王維如等人的一個重要原因。當然用武力去強行控制這裡地方到也不是不可以，但會落得一個專橫撥扈的名聲，有損於自己的聲謄。因此商毅如果能夠獲得浙江巡撫的職位，就能夠名正言順的控制浙江全省，並推行自己制定的各種制度，減少許多不必要的麻煩。

最後朝廷才下旨加封商毅為督都同知，出任浙江巡撫。同時商家軍的諸將也都得到了一次提升，周少桓和成進都晉見為副將、其他團長都晉升參將、團級軍官都升為遊擊將軍。

而崇禎的另一份，為商毅和朱媺娖指婚的遺詔，到是沒有引起多少爭議，一來是皇帝的女兒，愛嫁誰嫁誰，雖然商毅己經娶妻納妾，但關自己什麼事；二來各方勢力都顧著在新朝中爭權奪利，誰還在乎這個。因此這門婚事也得到一致的透過。只不過崇禎架崩，按制度朱媺娖是要守孝三年，實際為二十七個月，等孝期滿了以後，才能夠和商毅舉行婚禮。

不過就在五月十八日，朱媺娖上疏，表示崇禎的遺詔和玉璽都己經送到了南京，新君也己經登基繼位，自己的任務也己經完成，因此不願住在南京，請求能夠帶著朱媺婕，在外地安置定居。

這個要求到也合情合理，因為朱媺娖和朱媺婕到底不是朱由崧的親生女，朱由崧本身也是有兒有女的人，因此她們留在皇宮中也多有不便。

而馬士英也覺得，朱媺娖和商毅己是未婚的夫妻，留在南京說不定還成為商毅的耳目，還是把她們姐妹兩送出南京也更好一些，而