結果戰鬥進行了還不到一個小時，薩摩船隊的四十艘就被擊沉了二十餘艘，旗艦也被擊毀，主將島津忠朗、平田宗興也先後陣亡，而商家軍其實最多才使出七戍的功力，連霹靂火箭都沒有用。

這個時候日本人的武士精神畢竟還洠в猩仙�轎涫康賴募妒��諉髦�壞械氖焙潁�貢冉仙僂嬗袼椋�虼似漵嗟拇�灰滄瞿袷奚ⅲ�納⑻優堋６�饈蹦�嗆桶⒍��共糯�熳盼鞅淼旱慕⒍癰系秸匠±礎�

發現自巳趕到戰場時，戰鬥已經結束了，莫亞和阿爾維斯也都大吃了一驚，雖然說薩摩船隊的實力並不算強，但畢竟是有四十多條戰船，在這麼快的時間裡就取勝，也太快了，到底是因為商家軍的實力太強，還是薩摩船隊太弱，或者是亞莉桑德拉的指揮能力見長了。

亞莉桑德拉立刻下令，命莫亞和阿爾維斯立刻帶領艦隊，去收復石垣島，並且把第二分艦隊的七艘輔助戰艦都留給他們運送登陸計程車兵。而自己則帶領著其他的主力戰艦去追擊薩摩船隊的敗軍，以實現在戰前制定目標，全殲薩摩船隊。

儘管商家軍的戰船體和比薩摩船都要大，但速度卻要比薩摩船都快得多，而且整體火力也強，因此亞莉桑猿拉也下令，三級以上的戰船獨立追擊，三級以下的戰船以二三艘為一組追擊。不過薩摩戰船雖然是分散逃跑，但卻都是向著一個目標，就是宮古島。因此也十分好追。

從石垣島到宮古島之間，也就只有六七十里的距裡，在途中又有十餘條薩摩船被追上，有兩條船因為負隅頑抗，被商家軍擊沉，其餘被追上的薩摩船也都紛紛投降，由商家軍的戰船押著，回到石垣島，結果到了後來，只剩亞莉桑德拉帶領四艘戰船追趕，而薩摩船也剩下不足十艘。

到下午三點鐘左右，剩餘的薩摩戰船逃到了宮古島海域，但這時宮古島早己被成剛帶領的第三分艦隊佔領，島上的守軍和戰船不是被俘虜，就是被消滅。而成鋼一見薩摩船隊敗過來，也帶領著主力戰船出海攔截，結果在商家軍的前後夾擊之下，薩摩船隊果然一艘都沒有逃掉，被商家軍全殲。

到下午六時左右，亞莉桑徳拉帶領著船隊返回時，石垣島也己被商家軍收復，至此這一次先島海戰也全部結束，商家軍的海軍取得完勝，一共擊沉薩摩戰船三十二艘，擊斃薩摩軍的主將島津忠朗、平田宗興，打死薩摩士兵三千三百餘人，俘虜十三艘，生擒薩摩士兵一千六百餘人。其中還有四名翻譯。而商家軍自身，沒有一艘戰船被擊沉，士兵也僅僅只陣亡了二百餘人，而且基本都是在攻島的時候戰死的。

當天亞莉桑徳拉決定，今晚艦隊在西表島駐紮，一面派人回浙江去報告勝利的訊息，一面又招集海軍的將領，佈置下一階段的作戰計劃安排：在收復了石垣島之後，接下來就是進攻琉球島。

於是亞莉桑徳拉首先下令，停泊在基隆的後勤船隊立刻趕到西表島來，和大軍匯合，然後出兵進攻琉球島；莫亞和阿尓維斯帶領著西班牙僱傭艦隊，暫時留駐西表島和石垣島，把薩摩兵的俘虜都押送回臺灣收押，並且從臺灣徵調一批士兵過來，因為這一次的作戰目標是攻佔琉球島，需要一部份陸軍守衛。

琉球群島總體位於臺灣到日本之間，大體呈南北走向，包括有主要島嶼五十五個，陸地總面積為三千一百平方公里，按後世的劃分，由北向南可以分為三個較大島群：北部為奄美諸島鏈，中部為沖繩諸島，南部為先島諸島。

琉球島位於沖繩諸島的最南瑞，也就是後世的沖繩島，是琉球群島中最大的一個，總面積約為一千二百平方公里，也是目前琉球王朝的王都首裡城所在。佔領了琉球島，也就等於控制住了琉球王朝，就能夠佔據大名份，進而控制整個琉球群島，並且逐漸將薩摩藩的勢力逐出珫球群島的範圍。因此攻佔琉球島，也是這一次出兵的最主要目標，否則僅為保住先島諸島，商毅也不必這麼勞師動眾了。

琉球島距離西表島大約有七百餘的海路，按目前戰船的航程大約需要兩天的時間，而在琉球島西邊，有兩個小島，後世的名稱叫久米島、粟國島，離琉球島的海路約為五十里左右，因此亞莉桑德拉的目標，就是先佔領這兩個小島之一，作為商家軍的前沿落足點，然後以此為落足點，攻佔琉球島。

雖然在出戰之前，商毅也向海軍的各將領們詳細解釋了琉球島地理位置的重要性，以及佔領琉球島的作用，甚致還打出國家的旗幟，因為琉球王朝一直都是中國王朝的朝供蕃屬，接受中國的冊封，而現在被日本欺壓，因此這次出兵，也是解救明朝的葍屬，其意義和五十多年以前出兵援朝相同。