。下一步也就是恢復朝廷的秩序和運作，首先是確定內閣人選，首輔已由史可法出任，原來的兩名閣臣吳��源胃�嬡位Р可惺椋���婕嬡衛癲可惺欏�

而被馬士英罷職的一批東林黨人，也都陸續紛紛被招回朝中，又選了高弘圖和黃崇羲入閣理事。姜日廣出任吏部尚書，候恂出任刑部尚書，王鐸為工部尚書，黃道周、張慎言分別任都察院左右都御史，復社四公子這一次也都入朝為官，候方域任禮部待郎，方以智任少詹兼侍讀，陳貞慧和冒避疆出任御史，就連林之湖也弄了個戶部員外郎，比以前的主事到是升了一級。

對這些人選任命朱由崧到是言聽計從，一一照辦，顯得十分配合，這樣一來朝中的主要位職幾乎全由東林黨人出任，既使有些位置不是東林黨，但也沒有所謂的奸邪之徒了。

而就在第二天，候方域就上疏內閣，指出馬氏雖誅，餘黨猶在，要求朝廷查除馬士英的餘黨，這一建議也得到了許多人的支援，除了候方域的另三名好友，還有張慎言、黃道周等人，也都主張徹底湥Р槁淼秤嗍啤�

但這份上疏很快就被內閣駁回，史可法代表內閣答覆，朝廷己經言明，只誅馬士英，不牽連傍人，不可出爾反爾，而且馬士英本無黨閥，不必清查，同時以後此事也不可再論。

其實候方域上疏之後，在內閣裡黃宗羲是主張照辦的，嚴查馬士英的餘黨，但史可法、吳��技峋霾煌�猓�蛭�房煞ㄒ布塹蒙桃閎案媯�衷謖�嵌嗍輪�錚�彩碌幣暈榷ㄎ�鰨�員剛絞氐匚�亍Ｎ猱‘也十分贊同，而且馬士英出任首輔的時間只有一年，還沒有來得及大範圍安插自己的班底親信，因此馬黨除了阮大鋮之外，到還沒有多少有份量的人物，現在阮大鋮也己被逐，馬黨實際己煙消雲散了，就算有少許餘黨，也都是無足輕重的小角色，翻不起大lang，一但繼綾追查，擴大打擊面，難免有人會公報私仇、連累無辜。使朝廷又陷入混亂，而且又會牽扯朝廷的大量精力。

而另二位閣臣中，高弘圖也反對這麼做，只不過態度沒有史、吳兩人過麼強烈，而錢謙益一向見風使舵，一見現在是三比一，反對黨以大比分領先，立刻來了個錦上添花，也投了一票反對票，因此這個基調就這麼定了下來。同時史可法、吳��捕既銜��夤煞縉�膊荒蘢慍ぃ�匭肭苛Υ驁R下來，才會有這麼嚴厲的回覆。

就這樣候方域的上疏不僅被駁回，還被訓斥了一頓，碰了一鼻子灰。但現在史可法在南京的威望正高，又是東林前輩，小候也只好暗氣暗憋，另三個死黨這時也不敢胡亂出言相助。這件事情也就這麼給壓制下去了。

而就在這時，商毅取得魯南戰役勝利的告捷也發回了南京，商毅在告捷中到是實事求是，並沒有誇大其辭，說什麼血戰、力勝之類的話。實話說明許多地方的湥Ь�⒉歡啵�裁揮芯��裁創笳劍��だ�┮庖逶謨冢�廈髦沼詿蟯�撕蛻蕉�厙��淶穆鉸妨�怠�

不過儘管如此，又取得了勝利也總是讓人高興的，而且從形式上來說，南明朝廷也還一直堅守著山東地區，並沒有放棄北方的土地，因此也讓不少人感覺到南明的新興氣像，看來明朝好像還有中興的希望。

打了勝仗自然就要嘉獎，但現在商毅己經出任督師，這個官職己經夠高了，再要往上封，要麼是加三公的虛銜，要麼就是封公爵。不過這一次勝仗也是江淮之勝的延續，因此內閣也認為只對商毅進行嘉獎白銀十萬兩，彩綿千匹，官職這次就不升了。同時收復的地方，也全都由商毅管理，而對商家軍的部將中，周少桓、成進加封伯爵，而童大勇、王信、羅遠斌都封為子爵、就用這些中小爵位，糊弄過去算了。

而緊接著在湖廣一線也傳來戰報，阿濟格部也停止了進攻，退兵到德安、承天一線。而且多鐸、阿濟格等清軍主將也都被招回北京，這樣一來南明東西兩面的軍事也全部都解除了。

直到這時南明廷朝才算是徹底安全了下來，而在東林黨內部，也開始逐漸分化為左、中、右三個陣營，以黃宗羲、黃道周以及四公子為代表的激進冒險份子屬於左派；以吳���韉謀Ｊ厝聳渴粲謨遺桑歡�房煞ā⒏吆臚肌⑶��嫻卻蠖嗍�嗽蛭�辛⑴桑�還�諡辛⒄笥�敝校�房煞ā⒏吆臚枷勻皇瞧�蚋捎遺桑����嬖蚯閬蠐謐笈傘�

在南明朝廷舊的政治格局被徹底打破之後，新的格局也在逐漸形成著。

商毅收到南京朝廷的嘉獎和錢銀彩綿之後，又上了一份謝表。雖然他對朝廷的嘉獎並不感興趣，但對南京還是十分關注的，朝廷發生的變化他都己經知道了，看來自已的