發動了最後一波轟炸，剛剛越過錫爾河進入沙漠的卡察洛夫部根本找不到任何躲避的掩體，近400噸炸彈讓卡察洛夫再次損失數個營，還有數十輛卡車和裝甲車被隨後趕來的戰鬥機用機炮摧毀。一直在蘇軍後面運動的輪式裝甲營和哈薩克騎兵也趁機發動進攻，但因蘇軍早有準備，所以效果並不大。

隨著偵察機彙報卡察洛夫部鑽入沙漠，卓凡終止了全部行動下令清掃戰場，同時將克孜勒奧爾達阻擊戰的戰果通報發給了阿拉木圖司令部。從機降算起的三天三夜中。突擊旅、獵鷹大隊和隨後抵達的各支援部隊總計四千餘將士參加了阻擊戰，摧毀坦克和裝甲車237輛，各類大炮5百餘門，飛機137架。裝甲列車2列，還繳獲包括7輛t…34在內的大量武器輜重。有超過5千蘇軍被打死，還有2千餘被嚴重燒傷的傷兵在幾天後陸續死亡，俘虜2千。根據偵察機彙報。卡察洛夫部撤退時還帶走許多輕傷員。這樣算，三天戰鬥中總計大約有1。5萬蘇軍傷亡。而參加阻擊戰的國防軍同樣損失不小，有2141名士兵傷亡。其中死亡高達877人，損失坦克裝甲車61輛，損失17架飛機。兩個哈薩克獨立師也出現3千傷亡，還有至少1300名自願留下的哈薩克義勇軍和沒有及時撤離的哈薩克市民死亡。

無論對進攻的蘇軍還是對防守的國防軍來說，小而短的克孜勒奧爾達攻防戰都極具意義。尤其是卓凡利用狹窄街道和燃燒彈等粗劣工具對付坦克，用精心計算的機槍和速射武器編織火網等戰術，成為日後各國城市戰的標準戰術。而卡察洛夫採用的“重炮掃地”戰術也被國防軍迅速捕捉，鄭州工業公司立刻展開針對性研究，在36型底盤上改裝出專用的城市破障炮，命名為38型l20/210毫米“開山炮”，隨後又推出了更強的，帶305毫米短臼炮的41型“城市掃地車”。

到當天下午，李宗仁親率第七軍兩個師和一支三十人的戰地攝影隊抵達克孜勒奧爾達，配合熱茲卡茲甘的部隊，徹底封閉了鹹海北大門。同時，空降兵和星夜南下的第29軍也兵不血刃拿下突厥斯坦，還在希姆肯特擊潰蘇聯烏茲別克方面軍並佔領城市。隨著希姆肯特和克孜勒奧爾達相繼拿下，正式宣告為期兩個月的中亞哈薩克會戰結束。本來徐樹錚還建議由哈薩克集團軍配合安集延集團軍夾擊塔什干，但終因天氣越來越冷，塔什干又是真正地要塞，加上哈薩克集團軍已經連續作戰兩個月，楊秋和總參果斷停止了地面攻勢。還將原準備支援安集延集團軍的第33步兵軍調往阿富汗，馳援兵力不足的孫傳芳中亞集團軍。

讓人捧腹的是，為宣傳需要，卓凡不得不配合戰地攝影隊在城市東南的廢墟里再次放了把火，還讓正在錫爾河冬泳慶祝戰鬥勝利計程車兵重新穿上髒衣服，手腳臉上抹滿焦灰，淋上牛血，最後衝入“戰場”表現了一番無懼血火，勇猛殺敵、拯救中亞人民的史詩畫卷。

東哈薩克慘敗僅僅一週，克孜勒奧爾達就被封鎖的訊息讓斯大林怒不可遏。直接將提出讓卡察洛夫率部馳援盧金的總參謀長伏羅希洛夫和逃回來的庫利克降為上尉，發配到波羅的海軍區任連長，還撤消了阿帕納先科的總司令職務，把他趕到烏茲別克任方面軍司令。出人意料的是，在國防軍完成合圍前逃出生天的盧金被任命為新哈薩克方面軍總司令，弗拉索夫則出任副司令兼參謀長，最後還讓羅科索夫斯基出任車里雅賓斯克預備軍總司令，負責支援朱可夫和盧金。

後來貫穿整個戰爭的朱可夫、盧金和羅科索夫斯基的三駕馬車正式形成之際，斯大林又鑑於斯科沃爾特索夫等哈薩克高層被一鍋端的尷尬，下令提前疏散烏茲別克和土庫曼等地的高階官員和親蘇人士。最後還將貝利亞痛罵一頓，派日丹諾夫前往烏克蘭、烏法和車里雅賓斯克，就地督導t…34坦克的生產，要求在40年春季到來前將產量提高到每月1500輛，還讓加里寧去督管il2等飛機的製造工作，自己則親抓武器研製，希望儘早找到對付36型坦克和制空權的新式裝備。

儘管斯大林作出一系列調整，但蘇軍面臨的難題卻還是很多。從巴甫洛達爾至克孜勒奧爾達，巨大地哈薩克突出部將東方戰場分成兩個部分。一邊是三駕馬車率領的北線。一邊是阿帕納先科率領的南線，嚴重缺乏銜接。而且烏茲別克和西伯利亞就像張開的雙臂，雖然表面上看可以鉗擊哈薩克，但實際上卻形成了非常危險地懸臂狀態。如果說西伯利亞因為巴爾瑙爾等一串要塞化城市、廣袤縱深和泥濘的道路限制等還能守住。那麼幾乎都是平地沙漠的烏茲別克和土庫曼就非常容易被截斷。尤其是克孜勒奧爾達的丟失，更讓國防