在蘇聯境內，其歐洲部分西部的中央地帶，也即是佈列斯特至裡托夫斯克邊界東南，有一片南北寬約一百五十英里，縱橫三百多英里的遼闊沼澤地區，這就是普里皮亞特沼澤地，此處緩緩的河流縱橫交錯，不計其數。除了堤道上修了一兩條公路外，該地區的通道寥寥無幾，有些地方林木茂盛，成為坦克、裝甲車和摩托車輛的天然障礙。

在普里皮亞特沼澤地以北的白俄羅斯地區，儘管情況要好得多，但也有問題。這裡有通往明斯克、奧爾沙、斯摩稜斯克與莫斯科的直達交通線，在奧爾沙與莫斯科之間，道路兩側地形開闊，又無河川障礙，被稱之為奧爾沙陸橋，它是通向莫斯科的大門，是西德維納河和第聶伯河兩道水障之間的道路。德國士兵先要透過公路，穿越五十五英里多長的茂密林帶才能達奧爾沙陸橋，這些林間公路將使部隊像透過漏斗孔似的，把隊形拉得很長，無法組織防禦和進攻。

波羅的海地區，有幾條公路由東普魯士經波羅的海國家通往列寧格勒，但是公路質量極差。除涅曼河、大納爾瓦河外，還有許多沼澤地帶和茂密的森林，讓人望而生畏。列寧格勒與莫斯科之間的瓦爾代丘陵及其周圍地區，林木茂盛，沼澤遍佈，不利於裝甲部隊行進。

將領們還提出，蘇聯腹地是個漏斗形，突破得越深，正面就越開闊，開始時的一千三百英里鋒面將迅速擴大到兩千甚至三千英里。除非蘇軍在貝帕斯湖明斯克基輔一線以西的邊界附近被殲滅，不然德軍沒有足夠的力量扼守深入腹地時不斷加寬的正面。

後備軍總司令弗洛姆談了自己的看法，他認為在一片遼闊地區向六七百萬人、近百萬匹馬的部隊進行補給，會非常困難。何況，這個地區公路寥寥無幾，鐵路不能直達，因為蘇聯人的鐵軌比德國和中歐國家使用的都要寬。

另外，現在部隊後勤狀況不佳，剛剛結束的中東及北非作戰呼叫兵力雖然不多，但連續的作戰消耗了巨大的物資，目前坦克、裝甲車及摩托車輛奇缺，雖然佔領了產油地利比亞和埃及，但要轉化為燃油還需要三到五個月，庫存油料僅僅能支撐半年使用，由於缺乏天然橡膠與合成橡膠，輪胎也成了問題。

透過這番推演，陸軍總司令勃勞希契大吃一驚，他沒想到威風八面的國防軍，竟然存在這麼多問題。他想了想，問道：“我的元首，請問空軍是否有能力同時支援西線、東線和南線三線作戰？”

希特勒猶豫了一下，看向戈林。戈林立即回答：“沒問題，如果對蘇戰爭不拖長的話，空軍就能在三條戰線上作戰！”

勃勞希契皺了皺眉頭，沉默下來。

陸軍參謀長哈爾德上將發言說：“若是要進攻蘇聯，那麼中央集團軍群的主要突擊方向，就應該是莫斯科，不能有半點兒含糊，同時兩翼還必須配備有強大的裝甲部隊，以應付來自波羅的海或烏克蘭的側翼攻擊。”

希特勒自信地一笑：“對蘇戰爭的目的，是保衛帝國領土不受天空和陸地的攻擊，保護柏林及西里西亞的工業區，這就需要距離與縱深，使得粉碎後的蘇聯成為一些非武裝的社會主義行省，自波蘭邊境到伏爾加河，全由德國人駐防和統治。伏爾加河以東的原始土地，冰凍的西伯利亞，則留給疲弱的遠東共和國，以作為和南華共和國的緩衝。我們要確保，從歐亞大陸的任何地區，沒有轟炸機能夠飛到德國。”

隨後，希特勒進一步補充道：“根據我的推測，戰爭開始後，蘇聯會死守波羅的海與烏克蘭，因為那裡有海港，在經濟上至關重要，而對於中部，斯大林會慷慨相讓。因此，中央集團軍群的裝甲側翼，要準備向北進入波羅的海，向南進入烏克蘭。”

看到希特勒主意已定，將領們齊聲讚揚，稱這是一個偉大的計劃，而勃勞希契及哈爾德在保留自己意見的基礎上，聽從希特勒的指示，迅速開始制定作戰計劃。

五月十九日，希特勒以德國武裝部隊總司令的名義，發出了新的作戰指令巴巴羅薩計劃。

按照計劃要求，德國武裝部隊必須在準備對英戰爭結束之前，以一次快速戰役，徹底擊潰蘇聯，準備工作必須於下月十五日以前完成。

在希特勒主動制定的這份計劃中，進攻蘇聯分為兩個階段：

第一階段，首先用突然襲擊的方法，消滅蘇聯西部軍區的軍隊，然後在空軍的掩護下，以坦克部隊為先導，長驅直入，向蘇聯腹地進攻。

歐洲方向，進攻路線分南、北、中三路，北方集團軍群共計二十九個師，在以一千多架飛機的掩護下，由東普魯士出發，經德文斯克、奧斯特洛