便吵著要扶正，為了這樁事，吳還到山東蓬萊把吳家李家的族長請來洛陽開了一次聯席會議，這些老頭子都不贊成，搞得很不愉快。最後張夫人終於扶正。

13年1月28日，北京內閣總理孫寶琦移樽就教，親來洛陽訪吳，吳執弟子禮甚恭。

當吳極盛時代，在直系內部樹敵也是很多的，不只是曹錕左右，就是直系大將也和吳貌合神離。曹錕賄選前後，反直的國內派系曾組織三角同盟，前面已提到就是孫、段、張。而在直系內部亦有小三角聯盟反吳佩孚，觀察家如此說：“直系以外有三角聯盟，直系以內亦有小三角聯盟，小三角聯盟是以同盟罷工為逼曹去吳之手段。”

吳志在以武力統一中國，為了軍事行動，必須先求戰時指揮之統一，乃制定以師為單位，凡巡閱使、督軍之兼任師長者應解除師長一職。民國初年軍閥們不管官做到多大，絕對不放棄兵權，當時師是最大的軍隊編制，大軍閥們總是身兼師長。吳佩孚、齊燮元都是師長而兼巡閱使，其他多是師長而兼督軍。軍閥們心理很矛盾，一方面拼命往上爬，一方面又死守住師長位子不讓，大家都知道，沒有兵的話，巡閱使也好，督軍也好，都是空的，爬得愈高，會跌得愈重。

吳佩孚想統一軍權，就想削藩。他自己首先倡導，呈請辭去第三師師長兼職；曹錕卻不答應，曹說：“第三師是北洋正統，非老弟莫屬。”吳對曹仍極恭順，曹這麼說，吳也就不再堅辭；卻將直隸督軍王承斌所兼的第二十三師、河南督軍張福來之第二十四師、湖北督軍蕭耀南之第二十五師師長一律開去。還想開去齊燮元的第六師師長，王懷慶的第十三師師長、鄭士琦的第五師師長，這就招來了直系諸將的極大反對，鄭士琦表示寧願降階，辭去山東督軍而不放棄第五師師長。

13年5月，王承斌因師長被奪（吳派王維城繼任），而請辭直督，當時與王呼應的，有馮玉祥和齊燮元，這就是直系內部的小三角聯盟，他們的箭頭是指向吳佩孚。

王承斌去見曹錕時，當面提出辭職，曹問王為了什麼？王不好明講是因為師長被奪，只說情緒不好，曹很坦率地說：

“要不幹，在家一齊不幹。”

馮玉祥反吳，是因為河南督軍被撤職，當時吳要查辦馮，馮託了張紹曾和張廷鍔二人向曹錕去求情，曹打電報給吳說要調馮到北京當面查詢；吳礙於曹的面子，才讓馮去北京，馮到了北京，曹遂發表馮為陸軍檢閱使，吳只好同意，馮因此得以繼續保持他的軍權和軍隊。

齊燮元一方面是因為吳要他讓出師長職務，另一方面吳對於江浙的爭端，並不熱烈支援齊，所以參加反吳聯盟。

第二次奉直戰爭，在未開戰前，直系已是四分五裂了。

13年9月15日張作霖率奉軍入關後，在北京的曹錕便連打十萬火急、百萬火急、限即刻到的電報召吳佩孚入京。在洛陽的吳佩孚深知直系諸將離心離德，舊將不可用，而新兵又未練成，自己派到關外的“第五縱隊”羽毛尚未豐滿，後勤沒有準備，面臨的戰爭，完全沒有把握，內心頗感痛苦。可是曹錕的電報，加上大敵當前，他不能置之不理，於是乃於9月17日乘專車入京。

北京以隆重的禮節歡迎吳，從車站到總統府，五步一哨，十步一崗。直系大將馮玉祥、王承斌、王懷慶等都排隊歡迎，這是黎走曹繼以來，吳到北京的第一次，也是他生平最威武顯赫的一次。

曹錕充滿喜悅，像吞了一顆定心丸，堆著笑臉迎接吳，吳向他行禮，他連聲說：“子玉，辛苦你了；我老了，一切請你作主。”

直系諸將對吳都表示極端的恭順，吳本來顧慮內部不團結的疑雲為之一掃而空，他相信兄弟鬩於牆外禦其侮的大道理。

曹錕於吳入京的當天，下令討伐張作霖，特任吳佩孚為討逆軍總司令，王承斌為副司令，以四照堂為總司令部。

9月17日討逆軍吳總司令在四照常就職，並親筆點將，吳和總部政務處長白堅武各據長案一端，代理國務總理顏惠慶（國務總理原為顧維鈞代理，奉軍入關的第二天顧請辭職，曹乃派顏代理）走來時，白堅武竟大模大樣地端坐著，只把頭略點一下，意氣之盛，簡直不把堂堂國務總理放在眼下。

吳佩孚是測量學校出身，微時在吉林從軍有年，洞曉東北的山川形勢及每一軍略要地，他的點將，就是完完全全的作戰計劃：

第一軍總司令兼第一路司令彭壽莘（第十五師師長）

第一路副司令馮玉榮

軍副司令兼第二路司令王維城（第二十三師