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為了和緩李純、盧永祥之爭，北京政府乃採取一個折衷辦法，明令發表三案：

一、特任盧永祥為浙江督軍。

二、裁撤淞滬護軍使。改設淞滬鎮守使。

三、令何豐林為淞滬鎮守使。

在北京方面看來，這是一個兩全的辦法，可是浙方頗為不滿，因為淞滬在江蘇轄境內，護軍使可以不受督軍節制，但是鎮守使則必需受督軍節制。不但官職上完全不同，而且這一來仍然達到了李純吞吃淞滬的目的。因此盧永祥和何豐林均分別發出通電：

盧永祥何豐林聯名電：

“恭讀大總統命令，特授盧永祥為浙江督軍，淞滬護軍使著即裁撤，改設鎮守使，調任何豐林為淞滬鎮守使，此令等因。當此南北爭持之際，國是未定，人心未安，政府失其重心，大局日趨危險，淞滬地方重要，未便驟事更張，除電呈大總統外，現仍以盧永祥兼任淞滬護軍使名義，由豐林代行，維持現狀。謹此電聞，即請查照為荷。”

何豐林復自發一電向中央辭職，文雲：

“大總統國務院參陸部鈞鑒：恭讀大總統令，淞滬護軍使一缺，著即裁撤，改設淞滬鎮守使，調任何豐休為淞滬鎮守使，此令等因。奉令之下，惶悚莫名。伏念淞滬地方重要，綰轂東南，自民國四年裁併上海、淞江兩鎮守使，特設護軍使一職，直隸中央，當時設官分職，用意至為深遠。數年以來，迭經事變，用能本其職權，隨機應付。至去歲盧督調任後，學潮震盪，工商輟業，人心動搖，閭里虛驚，豐林一秉成規，倖免意外。現方南北相持，大局未定，忽奉明令，改設鎮守使，職權驟縮，地方既難維持，事機尤多貽誤，對內對外，鹹屬非宜。豐林奉職無狀，知難勝任，惟國家官制，必須因地制宜，不能因人而設。惟有退讓賢路，仰懇大總統准予免去淞滬鎮守使一職，以重舊制，而維大局，不勝屏營待命之至。”

隨著第四師第十師（都屬浙方）全體軍官拍電到北京，籲請收回裁撤淞滬護軍使的成命，任命何豐林為護軍使。這時北京方面正為了直皖決裂，戰端將啟，無心顧及東南，所以未立即答覆，何豐林疑是李純搞的花樣，即電李純有：“解鈴繫鈴，全在吾師”句，又聯合吳淞警備司令榮道一致電李純有：“同人等群相詰責，無詞應對，私心惴測，亦難索解，非中央欺吾師，即吾師欺學生”云云。原來何豐林和榮道一都是李純的學生。李純乃覆電表示心跡雲：“中央命令如果由兄指使，兄無顏見弟，無顏見人”。可是浙方仍不諒解，於是雙方劍拔弩張，分兵佈防。江蘇士紳結合各團體呼籲和平，李純平素以和平為號召，面對江浙之爭亦不願過火，一場紛爭總算雙方能懸崖勒馬。

9年8月4日，北京政府正式任命江蘇督軍李純為和談總代表。這時候，所謂南北之間已無和談可言，不過這個職位代表北京政府的誠意。李純一向以和平督軍自命，南北戰爭時候，他一直堅持要和談，南方對李純也有信心。

李純在江蘇督軍任內，最心腹的人是齊燮元，齊的正式官職是江寧鎮守使兼第六師師長，最後是江蘇軍務會辦。

後皖系失敗，皖系大將安徽督軍兼長江巡閱使倪嗣沖因病重被免職，北京政府命張文生暫署安徽督軍，而長江巡閱使一職由李純兼任，李純認為長江巡閱使徒擁虛名，不願擔任，乃派參謀長何恩溥赴京請辭長江巡閱使，請政府另選賢能。北京政府對這長江三督之首的李純特別垂青，乃將長江巡閱使裁去，改任李純為蘇皖贛巡閱使，齊燮元為副使。李純對此名義頗滿意，遂欣然接受。

怎知這個名義造成長江三督中蘇贛兩督的分裂，陳光遠認為屈居李純之下，心有不甘，竟公開宣稱：“情願歸鄂，不願歸蘇。”新任皖督張文生亦步陳光遠後塵，反對李純。江蘇士紳竟有“李督生平素稱不預民政”通電，請李移駐九江當塗。

這時江蘇政潮突起，更增複雜。原來江蘇省長齊耀琳和李純政見相左，呈請辭職，李純順水推舟，乃向北京政府保薦王克敏為省長，訊息傳出後蘇人大譁，認為王克敏除了嫖賭稱能，一無是處，如此人物，怎能擔任一省之長，遂函電紛馳，表示反對。在李純的保薦呈文上為王克敏陪襯的還有一名王瑚，曾做過京兆尹，尚孚民望。因此，北京政府既要接受民意，又要顧全李純的顏面，於是特任王瑚為江蘇省長。省長問題解決後，又發生江蘇省財政廳長問題。李純保薦張文龢為財政廳長，蘇人認為張文龢無行，且工諂媚，怎可掌理一省財政，所以大舉反對