都督和副都督後，立即召集重要的同盟會員和起義有功人員，研究當前應該解決的最為緊迫的問題。大家一致認為應該首先擴充武裝力量，光復全省；尤應派兵防堵清軍的反撲。於是，決定在都督之下成立4個標，以張煌、苗文華、劉漢卿、張瑜分任1至4標標統；並以姚以價為東路軍總司令，趙戴文為參謀長，率張煌第1標前往娘子關，防堵清軍進攻，並令姚部於當日下午出發。

據閻錫山回憶：

雖然在我舉義之次日，清廷即下詔罪己，准許革命黨人依法組黨，但有識者皆知此不過緩和革命欺騙世人的手法，並非真心悔禍，為中國的前途計，必須徹底摧毀清廷的統治。我雖然向軍民宣佈先求固守，然我的內心中總認為山西在崇山峻嶺之中，對清廷影響尚小，頂好是出兵直隸（今河北）正定，一方面可堵住山西的門戶，一方面可斷絕平漢路的交通。惟感力量不夠，又不敢輕作嘗試，於是僅先移師一部進駐娘子關，視清廷對我行動，再作攻守之計　。

同時閻錫山還決定以張瑜為北路軍總司令，率部北上攻佔雁門關並向大同進軍；以劉漢卿為南路軍總司令，南下河東，光復平陽、運城。

在南北兩路民軍出發之前，為了兵不血刃，和平解決光復問題，又決定派太平縣（汾城）舉人董桂萼赴南路進行招撫，派李苑林、胡行赴北路進行招撫（李、胡後被清軍殺害於雁門關關溝）。

以閻為首的