訊大哭，下詔給李如松在順天府（今北京長辛店附近）建了衣冠墳，並追授其少保、寧遠伯官銜，在廣寧府（今遼寧省北寧市）立祠，諡號忠烈。

李如梅接到父親李成梁派人送來的訃告，當時就哭暈了過去，在他的心中，李如松不但是長兄，更是自己的榜樣和精神支柱，這個打擊對他來說實在是太沉重了！高策、祖承訓、查大受、吳惟忠等東征將領聞訊都同樣異常震驚，紛紛趕來慰藉，並在軍營中為故帥設立了靈位，朝鮮國王李昖和大明平倭總督邢玠親自前來祭悼。不久，朝廷派來的使者也到了朝鮮，一番慰問後，傳達皇帝旨意，調李如梅火速回國，繼任遼東總兵一職。

李如梅走後，東征軍進行了必要的人事調整，由董一元接替李如梅職務，至此共有四位御倭總兵官，分別是麻貴、劉綎、董一元、陳璘。

邢玠命陳璘率水軍在海上設立封鎖線。其中明軍戰船270艘，士兵由廣東水師5000人和鄧子龍的江浙兵8000人組成，共13000人；朝鮮戰船250艘、士兵7328人。（注：有資料稱明軍東征水師實際擁有戰船500艘，經筆者考證，這是一個極度缺乏依據的說法，不可信。）

陸上因為接替楊鎬職務的天津巡撫萬世德尚未到任，邢玠只好親自坐鎮指揮，他慎重考慮之後，在軍事會議上擬定一個三路出擊的作戰方案：

東路軍由提督麻貴率領，負責進剿加藤清正，配置在安東、義城、義興、新寧、永川一線，共計明軍24000人；平安道、江原道慶尚左道朝鮮軍5514人。

西路軍主將為劉綎，負責進剿小西行長，配置在全州、南原一線