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土耳其政府支援的候選人是全美大車教阿瑟納戈拉斯。在過去二大年中，阿瑟納戈拉斯一直是一個突出的人物，“作出了一項看來幾乎是無法作到的事——拇美洲各國的正教團體都團結起來了”。不過要把他選出來，形式上也有困難，因為土耳其共和國曆來要求大主教一職應由土耳其人擔任，而網瑟納戈拉斯則於1938年拿到了美國公民證。不過，他是生在埃皮魯斯的，而埃皮魯斯當時卻是奧斯曼帝國的一個省。所以，他就合法地拿到了宗教會議的十一張選他的票，而其他六張則是空白的。接著，這位新大主教正式被授予了土耳其的國籍。有的報道說，他曾在華盛頓講過，這件事不過是“順水推舟”罷了，而在內心深處他還是保留著美國國籍的。在他離開美國時，他宣稱，他確信美國將會“給世界帶來它在為維護人類良由的尊嚴而進行的鬥爭中聽需要的精神上和道義上的力量”。遺憾的是他現在正要離開這塊“福地”了。不過，他正把“一個希望”帶往中東，“這就是“你們這裡所享有的四大良由就可能成為世界的四大自由了”。杜魯門最近再次當選為總統後的就職演說，將“為一個新的反對暴政的攻勢開闢道路”，而且也是“給鐵幕後的世界以希望和鼓舞的一次講話”。杜魯門總統還特地為他的這次旅行準備了一架由美國空軍人員駕駛的飛機。他的就職儀式於1949年1月27日舉行，蘇聯集團的國家沒有派代表參加。但是在慶祝他當大主教而舉行的首次禮拜儀式上，美國大西洋和地中海艦隊的總司令以及美國、英國和希臘的大使都出席了。1949年7月，他也仿照羅馬教皇的例子，釋出諭令把所有支援共產主義的人都逐出教門。

1948年9月15日，一年前逃出匈牙利以後寄居在美國的前匈牙利總理費倫茨·納吉拿著一張美國護照到了伊斯坦布林，表面上是作為一家美國雜誌的通訊記者來的。可是上耳其報紙卻報道說，他來的目的是想把巴爾幹各國逃出來的難民組織到一個共同反共陣線裡面。

9月19日，莫斯科電臺譴責他說，“在美國特務機關的唆使和慫恿下”，他想煽起鐵幕後的恐怖活動和破壞活動。上耳其政府隨即也發表了一項公報，說是政府已下令把從事反對別的國家的政治活動的人們都驅逐出境。於是納吉就悄悄地又溜回到西方去了。1949年4月，《真理報》從一件事裡又嗅到了特務活動的臭味。這就是一個退休的美國北卡羅來納州的傳教士和一個倫敦英國皇家地理學會的院士這時候分別組織了兩個探險隊去調查一份報告中所說的情況。該報告說，在一萬六千九百英尺高的阿勒山（即傳統所說的阿拉拉特山，位於同蘇聯和波斯相毗鄰的土耳其邊界上的斜坡處），有一塊地方的積雪反常地完全融化了，一個庫爾德人發現了“看來是一條船的化石遺物”。那些相信《舊約全書》中句句話都是真實的人們所作的解釋是，它只可能是諾亞方舟，而不可能是別的東西。《紐約先驅論壇報》描繪這件事所用的詞句是“多少有點古怪的探險隊”和“這樁明明白白異想大開的勾當”。《真理報》的評論員則疑心——或許不無理由——它是心裡懷有特務意圖而“手裡捧著《聖經》的假面舞會”。籌備中的英國探險隊的組織者（將由一個十九歲的荷蘭學生陪同），由於土耳其政府拒絕發給他們到這個戰略地區去的護照，最後是屈服了。但是他的那位美國競爭者則比較固執，而且口袋裡現鈔也多得多。所以儘管國務院加以阻止，E·艾倫·史密斯博士和他四個青年助手還是坐飛機到了土耳其。他們不但消除了土耳其政府的不安，而且後者還派了一個土耳其嚮導帶他到山的斜坡處進行考察。可是不久，他們就從那裡筋疲力盡地返回美國去了一隻發現了他們從事的工作過於艱鉅，他們的身體素質和登山經驗不能勝任。

與此同時，在蘇土關係史中也出現了更為