經略遼東，進駐山海關。

他一到任上，就藉口柳河兵敗為理由，撤掉山海關總兵馬世龍的職，讓他立即從錦州回到關內去，等候朝廷問罪。接著，高第準備將山海關外的駐兵全部撤進關內，完全採取不謀進取，只圖守關的消極防禦的策略。

由於高第畏敵如虎的政策，激起袁崇煥等將領的竭力反對。可是，高第憑藉著皇上賜給的尚方寶劍，又有魏忠賢及其死黨們的暗中支援，把將領們的建議置於腦後，固執己見，堅持把關外的駐軍撤回來。

高第不戰而退的策略，鬧得軍心不穩，民怨沸騰，難民塞於路，哭聲震於野，並且丟棄米慄十餘萬石，造成軍無戰心，士氣低落。

袁崇煥簡直氣炸了肺，自己辛辛苦苦修築的寧遠城，如此堅固的一座前沿堡壘，卻要拱手送給敵人，哪有這樣的道理？

對孫承宗的罷職，袁崇煥已早有察覺，頗為難過。

袁崇煥的性格剛直，膽略過人，從來不服邪的，對高第的專橫跋扈甚為不滿，特別是動轍以尚方寶劍論處，更為反感。袁崇煥對撤軍之事置之不理，高第也是不答應，執意要他撤軍，見袁崇煥拒不撤兵，又知道皇帝垂信於他，就不再堅持要袁崇煥從寧、前撤軍了。

但是，高第仍然用心險惡，他把寧遠、前屯以外的其他各城堡全都撤防，使寧遠城變成一座孤城！高第的用心之險惡，目的之卑鄙，手段之惡劣，都是前所未有過的。

後金汗王努爾哈赤，在佔領廣寧之後的四年之間，雖然派兵兩次打錦州，一次打松山，均遭敗績而歸，以後便不敢再興兵南犯了。

善於聞風而動的努爾哈赤，曾經乘著熊廷弼下臺之機，派兵奪佔遼瀋；這次又得到孫承宗被罷職還鄉，高第撤軍關內、寧遠城孤守的訊息